More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1585 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  724    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  75.28 
 
 
424 aa  551  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  76.02 
 
 
473 aa  544  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  53.1 
 
 
365 aa  381  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  49.85 
 
 
394 aa  344  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  51.87 
 
 
376 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  40.91 
 
 
360 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  45.01 
 
 
356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  41.91 
 
 
358 aa  272  8.000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  43.02 
 
 
363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  42.36 
 
 
377 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  42.17 
 
 
362 aa  266  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  39.88 
 
 
358 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  42.45 
 
 
360 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  43.15 
 
 
340 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  41.31 
 
 
363 aa  259  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  41.03 
 
 
363 aa  258  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  42.69 
 
 
377 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  40.83 
 
 
377 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  40.91 
 
 
352 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  40.74 
 
 
363 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  40.74 
 
 
378 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  41.03 
 
 
363 aa  256  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  39.89 
 
 
353 aa  255  9e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  41.53 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  40.17 
 
 
363 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  40.17 
 
 
363 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  39.89 
 
 
363 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  39.6 
 
 
363 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  41.83 
 
 
342 aa  248  9e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  38.42 
 
 
360 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  42.69 
 
 
349 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  39.71 
 
 
347 aa  222  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  41.23 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  38.44 
 
 
345 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  34.77 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  38.3 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  35.78 
 
 
342 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  36.42 
 
 
347 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  33.13 
 
 
353 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  32.53 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  31.68 
 
 
425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  30.06 
 
 
341 aa  133  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  30.25 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  28.09 
 
 
429 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  28.74 
 
 
464 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  31.75 
 
 
422 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  30.31 
 
 
414 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  28.45 
 
 
464 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  29.01 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  29.01 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  27.96 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  26.84 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  27.86 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  33.86 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  27.97 
 
 
417 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0918  hypothetical protein  29.67 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0936  hypothetical protein  29.67 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  26.13 
 
 
422 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  33.04 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  30.32 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3252  putative transporter  26.06 
 
 
431 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2530  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
431 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3530  putative transporter  26.06 
 
 
431 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3526  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
467 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  33.6 
 
 
439 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  28.12 
 
 
421 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  32.66 
 
 
443 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1310  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
431 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0452  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
431 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3505  putative transporter  26.06 
 
 
431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1137  CBS domain-containing protein  26.36 
 
 
431 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  29.66 
 
 
434 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  30.06 
 
 
454 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  28.57 
 
 
438 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  30.92 
 
 
443 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  30.92 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  26.51 
 
 
440 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  29.14 
 
 
444 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 
444 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
451 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  30.92 
 
 
451 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
451 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  32.93 
 
 
433 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2824  hypothetical protein  27.67 
 
 
425 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000593821  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  26.89 
 
 
428 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  30.16 
 
 
418 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  25.96 
 
 
449 aa  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  31.85 
 
 
444 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  30.74 
 
 
423 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0203  protein of unknown function DUF21  25.73 
 
 
429 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.228231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  27.02 
 
 
424 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2559  protein of unknown function DUF21  30.08 
 
 
410 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.764151  hitchhiker  0.000350536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  27.8 
 
 
487 aa  106  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  27.84 
 
 
440 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  28.06 
 
 
443 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  27.37 
 
 
443 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2704  protein of unknown function DUF21  27.02 
 
 
424 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  26.17 
 
 
429 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  31.33 
 
 
451 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>