More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3526 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0549  hypothetical protein  84.04 
 
 
401 aa  693    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000304401  normal  0.0362947 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2530  CBS domain-containing protein  99.77 
 
 
431 aa  875    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2654  hypothetical protein  77.64 
 
 
405 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0452813  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3526  CBS domain-containing protein  100 
 
 
467 aa  954    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3664  hypothetical protein  84.88 
 
 
430 aa  747    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000481216  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3505  putative transporter  99.53 
 
 
431 aa  870    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1137  CBS domain-containing protein  96.75 
 
 
431 aa  824    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0507  hypothetical protein  83.25 
 
 
400 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000590838  normal  0.67931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0505  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  79.8 
 
 
403 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175643  normal  0.331146 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0452  CBS domain-containing protein  99.77 
 
 
431 aa  875    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0097  hypothetical protein  82.71 
 
 
457 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000140223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3530  putative transporter  99.77 
 
 
431 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3451  protein of unknown function DUF21  79.64 
 
 
403 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00533306  hitchhiker  0.000732193 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1310  CBS domain-containing protein  99.77 
 
 
431 aa  875    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0482  hypothetical protein  83.92 
 
 
429 aa  733    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000251302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0579  hypothetical protein  82.71 
 
 
457 aa  756    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3252  putative transporter  99.77 
 
 
431 aa  875    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2817  hypothetical protein  84.82 
 
 
497 aa  764    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.292015  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  60.85 
 
 
424 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2704  protein of unknown function DUF21  61.32 
 
 
424 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2824  hypothetical protein  59.48 
 
 
425 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000593821  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0187  hypothetical protein  51.67 
 
 
429 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.691069  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0203  protein of unknown function DUF21  50.48 
 
 
429 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.228231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  49.18 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  51.36 
 
 
432 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0640  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  47.51 
 
 
423 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2371  transmembrane protein  48.15 
 
 
432 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.242025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  43.47 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  42.04 
 
 
426 aa  356  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  42.56 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  40.24 
 
 
440 aa  338  8e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  41.53 
 
 
426 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  39.56 
 
 
429 aa  334  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  41.36 
 
 
427 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  41.03 
 
 
431 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3019  hypothetical protein  40.09 
 
 
427 aa  329  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00496912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  42.71 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  38.66 
 
 
423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  41.22 
 
 
427 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  40.93 
 
 
423 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  38.7 
 
 
422 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  40.69 
 
 
423 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  41 
 
 
423 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  40.43 
 
 
423 aa  323  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  39.24 
 
 
424 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  41.04 
 
 
428 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0510  hypothetical protein  40.33 
 
 
420 aa  320  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.17258  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  39.71 
 
 
427 aa  320  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  40.6 
 
 
423 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  41.57 
 
 
426 aa  319  9e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  39.6 
 
 
423 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  39.7 
 
 
424 aa  316  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  40.6 
 
 
426 aa  316  5e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  40.44 
 
 
424 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  40.44 
 
 
424 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  40.44 
 
 
424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  40.44 
 
 
424 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  38.39 
 
 
413 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  38.39 
 
 
413 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  36.34 
 
 
427 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  38.77 
 
 
420 aa  312  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  38.77 
 
 
420 aa  312  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  38.77 
 
 
420 aa  312  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  38.77 
 
 
420 aa  312  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  36.34 
 
 
418 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  38.61 
 
 
421 aa  309  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  40.15 
 
 
421 aa  309  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  39.9 
 
 
421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03483  hypothetical protein  37.69 
 
 
395 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  38.77 
 
 
428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1429  transporter  37.29 
 
 
419 aa  302  7.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.836538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  37.84 
 
 
429 aa  302  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  37.47 
 
 
413 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  37.47 
 
 
413 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  37.47 
 
 
413 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  37.47 
 
 
413 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  36.71 
 
 
413 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  37.41 
 
 
418 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02501  predicted inner membrane protein  38.07 
 
 
398 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  37.22 
 
 
413 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02465  hypothetical protein  38.07 
 
 
398 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000805698  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  39.6 
 
 
417 aa  295  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  39.36 
 
 
417 aa  293  5e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  37.77 
 
 
426 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02692  hypothetical protein  38.89 
 
 
394 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000130738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1200  metal dependent phosphohydrolase  39.36 
 
 
426 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0996  hypothetical protein  37.14 
 
 
428 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1370  hypothetical protein  36.95 
 
 
429 aa  246  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  33.93 
 
 
435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15930  hemolysin  36.45 
 
 
430 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467501  normal  0.32719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  35.2 
 
 
417 aa  213  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  32.99 
 
 
435 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  32.99 
 
 
435 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  31.39 
 
 
437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  29.55 
 
 
433 aa  200  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  32.31 
 
 
434 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  34.46 
 
 
429 aa  196  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  30.52 
 
 
436 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  31.02 
 
 
436 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  30.07 
 
 
442 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>