More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2704 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2824  hypothetical protein  89 
 
 		 425 aa  773    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000593821  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2704  protein of unknown function DUF21  100 
 
 		 424 aa  867    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  98.82 
 
 		 424 aa  860    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3664  hypothetical protein  63.48 
 
 		 430 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000481216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0482  hypothetical protein  63.25 
 
 		 429 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000251302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2817  hypothetical protein  62.53 
 
 		 497 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.292015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0097  hypothetical protein  62.53 
 
 		 457 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000140223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0579  hypothetical protein  62.53 
 
 		 457 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2530  CBS domain-containing protein  61.56 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3530  putative transporter  61.56 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1137  CBS domain-containing protein  61.56 
 
 		 431 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0452  CBS domain-containing protein  61.56 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1310  CBS domain-containing protein  61.56 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3505  putative transporter  61.56 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3252  putative transporter  61.56 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3526  CBS domain-containing protein  61.32 
 
 		 467 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3451  protein of unknown function DUF21  61.48 
 
 		 403 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00533306  hitchhiker  0.000732193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0505  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  60.71 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175643  normal  0.331146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2654  hypothetical protein  60.2 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0452813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0507  hypothetical protein  61.79 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000590838  normal  0.67931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0549  hypothetical protein  61.28 
 
 		 401 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000304401  normal  0.0362947 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0203  protein of unknown function DUF21  55.85 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.228231 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0187  hypothetical protein  58 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.691069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  51.24 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  49.76 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0640  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  47.38 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2371  transmembrane protein  49.18 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.242025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  45.02 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  42.52 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  41.65 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  41.75 
 
 		 427 aa  346  5e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  41.02 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  39.9 
 
 		 440 aa  343  4e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  40.24 
 
 		 422 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  42 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  41.36 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  40.95 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  41.09 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  40.38 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  41.08 
 
 		 424 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  41.08 
 
 		 424 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  41.08 
 
 		 424 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  41.08 
 
 		 424 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  41.67 
 
 		 426 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3019  hypothetical protein  41.13 
 
 		 427 aa  335  7.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00496912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  39.91 
 
 		 427 aa  335  9e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  39.91 
 
 		 423 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  40.29 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  41.35 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  40.29 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  39.67 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  40.45 
 
 		 421 aa  332  9e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  39.23 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  41.73 
 
 		 429 aa  330  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  40.05 
 
 		 426 aa  328  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  38.97 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  42.33 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  42.33 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  39.24 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03483  hypothetical protein  39.95 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  39.26 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  39.02 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0510  hypothetical protein  39.38 
 
 		 420 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.17258  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  38.78 
 
 		 421 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  39.85 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  39.85 
 
 		 418 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  38.93 
 
 		 413 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  38.93 
 
 		 413 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  39.31 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  39.31 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  39.31 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  39.31 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  39.42 
 
 		 413 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1429  transporter  38.86 
 
 		 419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.836538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  38.82 
 
 		 426 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  38.44 
 
 		 413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  38.44 
 
 		 413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  38.44 
 
 		 413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  38.2 
 
 		 413 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  38.2 
 
 		 413 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1200  metal dependent phosphohydrolase  40.69 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02501  predicted inner membrane protein  38.38 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02692  hypothetical protein  39.9 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000130738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02465  hypothetical protein  38.38 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000805698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  36.45 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  39.35 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0996  hypothetical protein  37.2 
 
 		 428 aa  285  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1370  hypothetical protein  39.21 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15930  hemolysin  36.82 
 
 		 430 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467501  normal  0.32719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 		 417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  32.15 
 
 		 433 aa  219  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  34.91 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  31.55 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  32.63 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  34.13 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  32.58 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1470  CBS domain protein  34.88 
 
 		 415 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1279  CBS:transporter-associated region  34.64 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1016  hypothetical protein  33.17 
 
 		 413 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583006  normal  0.61306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>