More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2371 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2371  transmembrane protein  100 
 
 		 432 aa  860    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.242025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  55.72 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0640  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  51.67 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  52.39 
 
 		 426 aa  418  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  50.84 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  47.37 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2654  hypothetical protein  50.99 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0452813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  47.61 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  49.65 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2824  hypothetical protein  48.48 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000593821  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3664  hypothetical protein  49.29 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000481216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3451  protein of unknown function DUF21  51.14 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00533306  hitchhiker  0.000732193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0505  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  49.88 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175643  normal  0.331146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2817  hypothetical protein  48.49 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.292015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0097  hypothetical protein  49.05 
 
 		 457 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000140223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0579  hypothetical protein  49.05 
 
 		 457 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460959  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0482  hypothetical protein  48.39 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000251302  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2704  protein of unknown function DUF21  49.18 
 
 		 424 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  49.64 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0452  CBS domain-containing protein  48.38 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3530  putative transporter  48.38 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2530  CBS domain-containing protein  48.38 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3526  CBS domain-containing protein  48.15 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1310  CBS domain-containing protein  48.38 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3252  putative transporter  48.38 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1137  CBS domain-containing protein  48.61 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  45.96 
 
 		 428 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3505  putative transporter  48.38 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  45.95 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  44.52 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  45.95 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0510  hypothetical protein  45.72 
 
 		 420 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.17258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  44.76 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0507  hypothetical protein  48.59 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000590838  normal  0.67931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0549  hypothetical protein  49.1 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000304401  normal  0.0362947 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  44.73 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3019  hypothetical protein  47.52 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00496912  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  45.71 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  45.48 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  45.73 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  47.96 
 
 		 426 aa  365  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  45.71 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  45.48 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  45.48 
 
 		 423 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  44.26 
 
 		 424 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  44.91 
 
 		 428 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  44.9 
 
 		 421 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  45.95 
 
 		 424 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  45.95 
 
 		 424 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  45.95 
 
 		 424 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  44.34 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  45.71 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  44.76 
 
 		 427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  43.33 
 
 		 431 aa  352  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03483  hypothetical protein  44.25 
 
 		 395 aa  351  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  44.55 
 
 		 426 aa  350  4e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  42.24 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  40.76 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  41.69 
 
 		 418 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  43.06 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0203  protein of unknown function DUF21  44.39 
 
 		 429 aa  342  7e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.228231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  42.44 
 
 		 413 aa  342  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  42.44 
 
 		 413 aa  342  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  42.86 
 
 		 420 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  42.86 
 
 		 420 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  42.86 
 
 		 420 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  42.86 
 
 		 420 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  43.06 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  42.96 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  42.18 
 
 		 429 aa  335  7e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  41.22 
 
 		 413 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  41.22 
 
 		 413 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  41.22 
 
 		 413 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1429  transporter  40.9 
 
 		 419 aa  332  5e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.836538  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  41.22 
 
 		 413 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  41.22 
 
 		 413 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  43.07 
 
 		 417 aa  330  3e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  43.31 
 
 		 417 aa  330  3e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  40.98 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02692  hypothetical protein  45.31 
 
 		 394 aa  330  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000130738  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0187  hypothetical protein  44.85 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.691069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02501  predicted inner membrane protein  42.28 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  42.57 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02465  hypothetical protein  42.28 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000805698  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  42.33 
 
 		 421 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0996  hypothetical protein  44.05 
 
 		 428 aa  315  8e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1200  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 		 426 aa  309  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1370  hypothetical protein  40.95 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15930  hemolysin  41.84 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467501  normal  0.32719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  38.07 
 
 		 437 aa  247  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  35.63 
 
 		 442 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  35 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  35.17 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  34.93 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  37.11 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  36.04 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1016  hypothetical protein  33.94 
 
 		 413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583006  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  35.54 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  36.67 
 
 		 436 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  35.35 
 
 		 438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>