More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1200 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1200  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 426 aa  857    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  56.8 
 
 		 426 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  56.44 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3019  hypothetical protein  56.02 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00496912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  51.79 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  51.31 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  54.89 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  48.67 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  48.93 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  49.88 
 
 		 440 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  48.33 
 
 		 423 aa  398  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  49.18 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  48.57 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  49.76 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  48.33 
 
 		 427 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  50.48 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  46.19 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  50.95 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  49.29 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  50.71 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  47.62 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  50.71 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  50.71 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  48.59 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  48.83 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  50.24 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  49.3 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  48.36 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  49.06 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  47.74 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  50.23 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  49.29 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  49.77 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03483  hypothetical protein  48.72 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  43.25 
 
 		 418 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  43.25 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  43.1 
 
 		 421 aa  352  8e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  42.4 
 
 		 413 aa  352  8.999999999999999e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  41.91 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  41.91 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  42.61 
 
 		 421 aa  348  8e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  42.33 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  42.33 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  42.33 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  42.33 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  44.39 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  41.67 
 
 		 413 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  41.67 
 
 		 413 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  41.67 
 
 		 413 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  43.3 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  43.3 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  41.67 
 
 		 413 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  41.42 
 
 		 413 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  42.39 
 
 		 429 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1429  transporter  42.14 
 
 		 419 aa  336  5e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.836538  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0996  hypothetical protein  45.91 
 
 		 428 aa  334  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  43.18 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02692  hypothetical protein  45 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000130738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02501  predicted inner membrane protein  41.22 
 
 		 398 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02465  hypothetical protein  41.22 
 
 		 398 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000805698  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2371  transmembrane protein  43.33 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.242025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  40.24 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2704  protein of unknown function DUF21  40 
 
 		 424 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1370  hypothetical protein  47.06 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2824  hypothetical protein  39.86 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000593821  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15930  hemolysin  46.67 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467501  normal  0.32719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3664  hypothetical protein  37.71 
 
 		 430 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000481216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  41.31 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0505  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  38.44 
 
 		 403 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175643  normal  0.331146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2817  hypothetical protein  38.57 
 
 		 497 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.292015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3451  protein of unknown function DUF21  38.44 
 
 		 403 aa  299  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00533306  hitchhiker  0.000732193 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0097  hypothetical protein  37.84 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000140223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0579  hypothetical protein  37.84 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460959  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0482  hypothetical protein  37.23 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000251302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2654  hypothetical protein  38.17 
 
 		 405 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0452813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3530  putative transporter  39.36 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3252  putative transporter  39.36 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0452  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1310  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2530  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3505  putative transporter  39.36 
 
 		 431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3526  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 		 467 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1137  CBS domain-containing protein  38.88 
 
 		 431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0203  protein of unknown function DUF21  37.41 
 
 		 429 aa  280  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.228231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0510  hypothetical protein  37.65 
 
 		 420 aa  276  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.17258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0549  hypothetical protein  36.64 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000304401  normal  0.0362947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0507  hypothetical protein  36.39 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000590838  normal  0.67931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0187  hypothetical protein  36.74 
 
 		 429 aa  270  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.691069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0640  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  36.71 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  34.71 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1279  CBS:transporter-associated region  39.12 
 
 		 415 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1470  CBS domain protein  38.8 
 
 		 415 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  35.35 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  35.92 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1016  hypothetical protein  36.97 
 
 		 413 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583006  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  36.04 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  36.14 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  34.05 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  35.82 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  33.25 
 
 		 442 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>