More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0507 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 341 aa  695    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0936  hypothetical protein  76.75 
 
 		 346 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0918  hypothetical protein  76.75 
 
 		 346 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  35.91 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  36.22 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  34.27 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  35.84 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  34.24 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  30.91 
 
 		 464 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  32.63 
 
 		 417 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  31.21 
 
 		 464 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  30.79 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  30.91 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  31.72 
 
 		 435 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  33.63 
 
 		 436 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  31.36 
 
 		 429 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  32.23 
 
 		 436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  32.92 
 
 		 429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  29.65 
 
 		 442 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  30.15 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  30.03 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  28.83 
 
 		 424 aa  159  8e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  31.9 
 
 		 424 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  30.37 
 
 		 468 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  30 
 
 		 438 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  32.41 
 
 		 426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  30.52 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  30.42 
 
 		 429 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  29.82 
 
 		 442 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  29.82 
 
 		 442 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  31.8 
 
 		 440 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  29.82 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  30.87 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  31.58 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  30.4 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  31.5 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  29.65 
 
 		 422 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  33.23 
 
 		 420 aa  153  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  30.75 
 
 		 455 aa  153  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  31.07 
 
 		 424 aa  152  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  31 
 
 		 434 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  31.5 
 
 		 447 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  30.53 
 
 		 427 aa  152  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  30.84 
 
 		 455 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  30.29 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  28.8 
 
 		 423 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  29.67 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  31.6 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  28.53 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  29.02 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  28.99 
 
 		 445 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  28.62 
 
 		 422 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0320  CBS domain-containing protein  28.49 
 
 		 432 aa  149  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00497415  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  28.01 
 
 		 465 aa  149  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  31.33 
 
 		 418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  31.07 
 
 		 434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  31.33 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  29.45 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  29.32 
 
 		 429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  29.69 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  30.65 
 
 		 426 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  28.1 
 
 		 447 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  30.6 
 
 		 425 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  30.65 
 
 		 424 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  31.04 
 
 		 436 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  31.86 
 
 		 445 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  29.97 
 
 		 429 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  29.52 
 
 		 421 aa  145  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  31.04 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2704  protein of unknown function DUF21  30.96 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  31.78 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  27.86 
 
 		 487 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  30.82 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0912  hypothetical protein  29.72 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  30.94 
 
 		 430 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1137  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  28.57 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  29.38 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  29.11 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  29.38 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  29.38 
 
 		 413 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  28.99 
 
 		 429 aa  143  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  31.2 
 
 		 442 aa  143  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  29.75 
 
 		 427 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3664  hypothetical protein  30.27 
 
 		 430 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000481216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  29.45 
 
 		 427 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  28.83 
 
 		 477 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  29.25 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0210  hypothetical protein  30.77 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  29.02 
 
 		 443 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  29.02 
 
 		 443 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2530  CBS domain-containing protein  30.27 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  29.75 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0452  CBS domain-containing protein  30.27 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1310  CBS domain-containing protein  30.27 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>