More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1275 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  963    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  93.19 
 
 		 424 aa  804    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  75 
 
 		 357 aa  551  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  53.62 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  50.88 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  50.61 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  46.99 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  42.9 
 
 		 378 aa  289  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  44.82 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  43.37 
 
 		 363 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  43.09 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  43.38 
 
 		 360 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  43.37 
 
 		 363 aa  286  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  42.86 
 
 		 362 aa  285  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  43.82 
 
 		 377 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  42.82 
 
 		 363 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  42.27 
 
 		 363 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  41.99 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  42.27 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  41.99 
 
 		 363 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  43.38 
 
 		 356 aa  273  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  43.49 
 
 		 363 aa  271  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  43.28 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  43.35 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  42.9 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  43.64 
 
 		 377 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  40.33 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  41.48 
 
 		 340 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  42.73 
 
 		 349 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  40.11 
 
 		 358 aa  253  6e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  41.28 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  38.79 
 
 		 358 aa  249  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  38.78 
 
 		 347 aa  229  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  40.82 
 
 		 349 aa  227  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  39.23 
 
 		 345 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  33.44 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  33.14 
 
 		 353 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  36.99 
 
 		 347 aa  179  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  33.54 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  35.31 
 
 		 345 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  33.14 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  31.12 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  29.3 
 
 		 420 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  31.21 
 
 		 414 aa  134  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  28.4 
 
 		 464 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  28.61 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  28.01 
 
 		 464 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  28.61 
 
 		 464 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  29.85 
 
 		 422 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  29.87 
 
 		 426 aa  126  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  31.77 
 
 		 448 aa  126  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0918  hypothetical protein  29.81 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0936  hypothetical protein  29.81 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  32.78 
 
 		 423 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  28.8 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  30.65 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  27.78 
 
 		 421 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  27.78 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  30.46 
 
 		 417 aa  117  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  32.94 
 
 		 420 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  28.48 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  32.21 
 
 		 439 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  30.58 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  29.78 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  28.24 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  31.16 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  26.13 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  28.99 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  32.08 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  26.65 
 
 		 444 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  29.8 
 
 		 444 aa  110  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2329  protein of unknown function DUF21  30.45 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.207068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  28.74 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1682  protein of unknown function DUF21  27.94 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000471578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  29.31 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  27.78 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  29.15 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  28.21 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  26.9 
 
 		 446 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  27.17 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  29.46 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  27.6 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  29.15 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  31.91 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  27.71 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  31.91 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  32.51 
 
 		 443 aa  106  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  29.13 
 
 		 426 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  28.9 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  27.84 
 
 		 432 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  28.9 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  28.9 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  28.9 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  27.52 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  27.9 
 
 		 443 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  27.5 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4107  protein of unknown function DUF21  25.94 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  26.51 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  28.42 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  30.65 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>