More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00214 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  100 
 
 
377 aa  768    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  93.9 
 
 
377 aa  677    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  78.12 
 
 
352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  69.69 
 
 
353 aa  512  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  48.16 
 
 
363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  48.16 
 
 
378 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  47.88 
 
 
363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  47.31 
 
 
363 aa  323  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  45.14 
 
 
360 aa  322  6e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  46.74 
 
 
363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  46.74 
 
 
363 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  46.46 
 
 
363 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  46.3 
 
 
377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  46.37 
 
 
362 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  46.18 
 
 
363 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  46.18 
 
 
363 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  46.07 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  46.65 
 
 
360 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  47.86 
 
 
356 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  49.7 
 
 
376 aa  292  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  45.8 
 
 
340 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  43.01 
 
 
424 aa  288  8e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  42.33 
 
 
357 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  46.41 
 
 
394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  42.82 
 
 
473 aa  280  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  41.96 
 
 
342 aa  280  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  45.51 
 
 
365 aa  279  7e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  45.35 
 
 
360 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  41.9 
 
 
363 aa  269  7e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  38.67 
 
 
358 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  37.18 
 
 
358 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  41.14 
 
 
349 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  41.12 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  36.45 
 
 
344 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  37.61 
 
 
345 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  37.2 
 
 
347 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  36.61 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  31.78 
 
 
342 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  29 
 
 
353 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  31.71 
 
 
347 aa  169  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  28.44 
 
 
417 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  30.46 
 
 
425 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  28.8 
 
 
420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  26.77 
 
 
420 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  30.09 
 
 
421 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  26.1 
 
 
424 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  27.11 
 
 
422 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  28.8 
 
 
414 aa  123  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  28.62 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  26.89 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  26.02 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  26.02 
 
 
424 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  28.79 
 
 
422 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  27.15 
 
 
424 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  27.73 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  26.52 
 
 
428 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  29.37 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  26.16 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  30.56 
 
 
426 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  32.6 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  27.49 
 
 
447 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  25.41 
 
 
427 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  28.17 
 
 
428 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  26.27 
 
 
427 aa  116  7.999999999999999e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  25.32 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  26.35 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  26.01 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  27.08 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  27.46 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  28.62 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  30.4 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  25.72 
 
 
433 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.4 
 
 
445 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  29.14 
 
 
427 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  28.66 
 
 
432 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  24.56 
 
 
428 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  25 
 
 
422 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  27.72 
 
 
427 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  27.11 
 
 
446 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  25.75 
 
 
435 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03483  hypothetical protein  24.75 
 
 
395 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  25.25 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  27.43 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  27.96 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  27.47 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  26.45 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  28.27 
 
 
433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  26.98 
 
 
421 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  26.07 
 
 
446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  27.09 
 
 
448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  28.01 
 
 
433 aa  110  5e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  25.72 
 
 
444 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  26.98 
 
 
421 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  27.06 
 
 
429 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1137  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 
431 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  28.48 
 
 
424 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  28.94 
 
 
464 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2329  protein of unknown function DUF21  31.56 
 
 
372 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.207068  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  27.72 
 
 
428 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  27.56 
 
 
425 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>