More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2847 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  100 
 
 		 353 aa  726    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  70.32 
 
 		 377 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  69.74 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  67.05 
 
 		 352 aa  490  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  45.87 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  45.01 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  45.87 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  45.87 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  45.58 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  45.3 
 
 		 363 aa  315  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  45.58 
 
 		 363 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  45.3 
 
 		 363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  45.3 
 
 		 363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  45.58 
 
 		 363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  45.63 
 
 		 356 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  46.48 
 
 		 356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  43.14 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  45.87 
 
 		 360 aa  305  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  45.51 
 
 		 377 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  43.28 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  40.24 
 
 		 342 aa  281  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  42.44 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  42.39 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  43.69 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  43.19 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  39.89 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  43.67 
 
 		 376 aa  265  8e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  41.92 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  37.82 
 
 		 363 aa  242  6e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  35.16 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  39.27 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  34.87 
 
 		 358 aa  235  8e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  38.1 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  35.63 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  34.23 
 
 		 345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  34.42 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  32.28 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  31.61 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  30.86 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  30.03 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  28.66 
 
 		 422 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  29.5 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  27.46 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  28.16 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  27.19 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  28.61 
 
 		 464 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  27.3 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  28.44 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  27.25 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  27.73 
 
 		 464 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  25.87 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  26.3 
 
 		 433 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  27.14 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  27.86 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  29.63 
 
 		 423 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  29.81 
 
 		 443 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  29.55 
 
 		 432 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  27.51 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15621  hypothetical protein  24.61 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  29.55 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  29.81 
 
 		 443 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  26.58 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  24.25 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  25 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  24.67 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  29.69 
 
 		 451 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  28.62 
 
 		 447 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  26.71 
 
 		 421 aa  115  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  28 
 
 		 426 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  28.08 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  25.08 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  29.3 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  29.3 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2329  protein of unknown function DUF21  32.52 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.207068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  29.3 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  29.3 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  28.91 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  25.83 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  28.91 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0210  hypothetical protein  27.34 
 
 		 428 aa  112  7.000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  26.99 
 
 		 433 aa  112  7.000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2371  transmembrane protein  27.67 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.242025 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  25.5 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1422  hypothetical protein  30.09 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  25.5 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  30.67 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  25.73 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  27.78 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  25.08 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  26.92 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  26.92 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  26.28 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  30.35 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  23.56 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  25.16 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  27.44 
 
 		 424 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  25.3 
 
 		 429 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  26.14 
 
 		 440 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>