More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0112 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0112  transcriptional regulator  100 
 
 		 484 aa  1006    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3902  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  59.91 
 
 		 467 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178429  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 483 aa  335  9e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.84 
 
 		 487 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 483 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  37.05 
 
 		 504 aa  315  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 504 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 478 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.01 
 
 		 487 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.42 
 
 		 487 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  34.66 
 
 		 482 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.18 
 
 		 492 aa  286  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.97 
 
 		 480 aa  286  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  34.26 
 
 		 473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 472 aa  282  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.6 
 
 		 517 aa  282  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  33.19 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 473 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 492 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 475 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 474 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  33.4 
 
 		 475 aa  281  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  32.85 
 
 		 479 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 473 aa  279  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 479 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  34.33 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 473 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  33.69 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.69 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  33.69 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.03 
 
 		 475 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  33.26 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  34.54 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  33.69 
 
 		 468 aa  276  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 483 aa  275  9e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 		 479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.3 
 
 		 486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  33.26 
 
 		 476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 468 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 479 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  34.54 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.48 
 
 		 475 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 468 aa  273  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 474 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 474 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 475 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 496 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 496 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  34.32 
 
 		 480 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 487 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 474 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 475 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 530 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.71 
 
 		 486 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 474 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 469 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  33.48 
 
 		 474 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  32.78 
 
 		 479 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 474 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.83 
 
 		 478 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  33.05 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  33.82 
 
 		 500 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.83 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  33.26 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 532 aa  267  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  32.92 
 
 		 471 aa  267  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  33.62 
 
 		 474 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 478 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 474 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  33.62 
 
 		 474 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  33.62 
 
 		 474 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  33.62 
 
 		 474 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  33.62 
 
 		 474 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 473 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  31.12 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  33.05 
 
 		 474 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  31.57 
 
 		 493 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 471 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 474 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 474 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 477 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 481 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>