More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0101 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
333 aa  658    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.389719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.83 
 
 
332 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  50 
 
 
291 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.75 
 
 
309 aa  237  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  47.77 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  47.77 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  47.77 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 
301 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.44 
 
 
311 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 
301 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 
351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  45.08 
 
 
304 aa  219  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
301 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.07 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.39 
 
 
310 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.4 
 
 
301 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.12 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  45.52 
 
 
293 aa  195  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.56 
 
 
301 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1440  short chain dehydrogenase  44.33 
 
 
292 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110172  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1567  short chain dehydrogenase  43.79 
 
 
292 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2162  short chain dehydrogenase  38.59 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0642494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.13 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
307 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  40.43 
 
 
305 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  39.59 
 
 
304 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
316 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
304 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 
295 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0301086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
304 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
305 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 
300 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
306 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
304 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
305 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
303 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
303 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
292 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.39 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  41.96 
 
 
292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
309 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
303 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
913 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
303 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4620  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
307 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4708  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
307 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
301 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
304 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
306 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
304 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27323  normal  0.448536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
306 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
306 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
304 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 
300 aa  143  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  37.63 
 
 
350 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.72 
 
 
275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.72 
 
 
275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5894  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.67 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.72 
 
 
275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.58 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
313 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
298 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
313 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
303 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  39.04 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.263864  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.45 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518156  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  38.21 
 
 
901 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13536  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.54 
 
 
317 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.721751  hitchhiker  0.00000286322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
301 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1553  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.1 
 
 
310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
253 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  41.25 
 
 
303 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.28 
 
 
275 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.309942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  41.25 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  decreased coverage  0.000184806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5205  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.26 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.152871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
306 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.69 
 
 
246 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 
275 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.077529  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.555995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4075  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  40.28 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.374557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
710 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.011223  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>