More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2626 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2755  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  99.7 
 
 
668 aa  1342    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2626  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  100 
 
 
668 aa  1347    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339586  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2650  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  99.7 
 
 
668 aa  1344    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2537  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  99.7 
 
 
668 aa  1344    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2586  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  99.7 
 
 
668 aa  1344    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0953396  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0643  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtB  40.08 
 
 
789 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.787041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3242  phosphoglycerate transport regulator  39.31 
 
 
787 aa  170  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
790 aa  170  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2752  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
790 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.296957  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
630 aa  158  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.941233  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  32.54 
 
 
620 aa  157  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
621 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  35.63 
 
 
604 aa  147  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  37.33 
 
 
630 aa  140  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  35.14 
 
 
622 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  35.46 
 
 
600 aa  138  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  38.08 
 
 
667 aa  138  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  37.6 
 
 
615 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  34.58 
 
 
597 aa  135  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  35.66 
 
 
616 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  35.6 
 
 
602 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
620 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  33.06 
 
 
623 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  36.67 
 
 
617 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  31.62 
 
 
611 aa  128  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
672 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
622 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  34.78 
 
 
600 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  36.25 
 
 
604 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  36 
 
 
604 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
585 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572324  normal  0.76853 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
597 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0801303  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  35.86 
 
 
630 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  35.25 
 
 
621 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
621 aa  124  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  37.66 
 
 
633 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  36.16 
 
 
621 aa  124  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  34.72 
 
 
670 aa  124  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  34.96 
 
 
666 aa  124  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  35.71 
 
 
626 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
604 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  36.02 
 
 
618 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  36.43 
 
 
588 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  32.17 
 
 
594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
637 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1815  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  34.75 
 
 
659 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  35.56 
 
 
623 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
602 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  36.58 
 
 
586 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
683 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
618 aa  120  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
604 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  35.18 
 
 
604 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  35.38 
 
 
666 aa  120  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  34.22 
 
 
665 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  35.71 
 
 
603 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  35.18 
 
 
604 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  31.38 
 
 
604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
586 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  36.97 
 
 
597 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
606 aa  117  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  32.4 
 
 
599 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4771  histidine kinase  35.17 
 
 
624 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.415438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
672 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  36.84 
 
 
622 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
677 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  34.62 
 
 
668 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  33.76 
 
 
601 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
591 aa  115  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
622 aa  115  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  34.56 
 
 
669 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
669 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  36.97 
 
 
600 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  32.8 
 
 
612 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
669 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
634 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  34.73 
 
 
669 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
585 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
503 aa  114  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
534 aa  114  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
630 aa  114  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
585 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1611  sensor histidine kinase  35.32 
 
 
597 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
597 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  35.37 
 
 
625 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
635 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  35.37 
 
 
625 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
634 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  35.68 
 
 
585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  31.98 
 
 
608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206032  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2874  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
693 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0266107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0265  histidine kinase  34.92 
 
 
597 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.937441  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
604 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362965  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
604 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>