More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2028 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2028  PAS sensor protein  100 
 
 		 569 aa  1172    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0281  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 		 526 aa  241  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.630164  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.94 
 
 		 681 aa  130  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 701 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.282736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 861 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 		 685 aa  115  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1253  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 673 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.93 
 
 		 983 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  24.82 
 
 		 1258 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.8 
 
 		 1808 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.96 
 
 		 982 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  29.14 
 
 		 615 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 591 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.45 
 
 		 1262 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  22.94 
 
 		 812 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 760 aa  107  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.08 
 
 		 683 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  27.24 
 
 		 617 aa  106  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 921 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  26.25 
 
 		 623 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 652 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  27.27 
 
 		 600 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2189  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 726 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  22.97 
 
 		 516 aa  104  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  30.22 
 
 		 604 aa  104  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 683 aa  103  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 1168 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  26.09 
 
 		 669 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.82 
 
 		 675 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 669 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1462  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 600 aa  103  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0277816  normal  0.69414 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 669 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.18 
 
 		 849 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.101601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.83 
 
 		 871 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0076  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000670582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.45 
 
 		 789 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774871 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 672 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.99 
 
 		 1139 aa  101  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 677 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 671 aa  101  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.918325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 603 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.05 
 
 		 673 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.79 
 
 		 677 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.8 
 
 		 713 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 603 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  28.4 
 
 		 600 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  27.53 
 
 		 603 aa  100  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  26.09 
 
 		 668 aa  100  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  27.27 
 
 		 597 aa  100  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 1036 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  26.09 
 
 		 669 aa  100  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 588 aa  100  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206032  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.65 
 
 		 688 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 659 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  26.81 
 
 		 667 aa  99.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 628 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1550  sensor histidine kinase  28.81 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000335626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 604 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 756 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  29.17 
 
 		 577 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  22.86 
 
 		 1258 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2129  sensor histidine kinase  29.51 
 
 		 587 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3832  sporulation kinase  29.17 
 
 		 421 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000527947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 577 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  20.38 
 
 		 893 aa  98.2  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 1072 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 586 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  28.14 
 
 		 592 aa  98.2  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  24.36 
 
 		 1379 aa  98.2  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1339  sensor histidine kinase, C-terminal region; sporulation kinase  28.81 
 
 		 420 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 826 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1136  putative C4-dicarboxylate transport sensor protein  28.17 
 
 		 684 aa  97.8  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00183456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1340  sporulation kinase  28.81 
 
 		 420 aa  97.4  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  30.12 
 
 		 737 aa  97.1  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 571 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 515 aa  97.4  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0491  hydrogen uptake histidine-kinase  24.07 
 
 		 443 aa  97.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.19 
 
 		 1465 aa  97.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 443 aa  97.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2430  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.6 
 
 		 420 aa  97.1  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1583  sensor histidine kinase, putative  28.81 
 
 		 423 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 578 aa  97.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  28.29 
 
 		 630 aa  97.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  27.52 
 
 		 633 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 587 aa  96.3  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.62 
 
 		 1780 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  26.35 
 
 		 666 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 604 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  25.18 
 
 		 1850 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  24.13 
 
 		 971 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  26.62 
 
 		 666 aa  96.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 598 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2543  sensor histidine kinase  27.05 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  28.05 
 
 		 598 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2268  histidine kinase  30.47 
 
 		 571 aa  95.5  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467853  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  27.8 
 
 		 770 aa  96.3  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 598 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 598 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  30.36 
 
 		 621 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>