109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2113 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2113  GumN  100 
 
 		 302 aa  596  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  44.78 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  36.43 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  37.41 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  31.58 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  34.34 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  35.69 
 
 		 300 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  27.34 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  28.09 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  25.09 
 
 		 476 aa  95.5  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  25.41 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  27.14 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  28.3 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  30.26 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  29.89 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  25.5 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  26.3 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  28.14 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  25.95 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  25.19 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  29.32 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  29.1 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  25.47 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  26.49 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  27.87 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  25.49 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  28.41 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  24.68 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  24.62 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  27.95 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  21.9 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  31.75 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  23.35 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  29.61 
 
 		 358 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  26.19 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  26.19 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  26.19 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  26.93 
 
 		 383 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  27.4 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1236  hypothetical protein  31.82 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  26.34 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  30.92 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  27.59 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  21 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  25.85 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  25.5 
 
 		 381 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  27.94 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  26.96 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  25.42 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  25.42 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  28.63 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  25.68 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  25.68 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  28.14 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  27.34 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  25.42 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  25.42 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  25.93 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  25 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  25.33 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  25.93 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  26.04 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  26.04 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  25.93 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  25.29 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  25.59 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  28.57 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2887  GumN family protein  28.79 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  26.04 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  25.59 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  25.59 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  25.59 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  24.35 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  28.1 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  26.2 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  29.31 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  23.02 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  22.92 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  24.72 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  24.11 
 
 		 363 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  24.72 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  26.55 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  23.64 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  22.62 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  24.17 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  24.17 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  24.17 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  24.17 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  22.62 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  28.31 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  24.17 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  26.35 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  27.24 
 
 		 401 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  22.22 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  22.22 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  22.22 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  22.22 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  21.84 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4882  GumN family protein  27.05 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>