92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3085 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  90.55 
 
 		 381 aa  680    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  99.21 
 
 		 381 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  90.55 
 
 		 381 aa  680    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  100 
 
 		 381 aa  763    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  90.55 
 
 		 381 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  91.34 
 
 		 381 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  90.58 
 
 		 382 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  73.99 
 
 		 378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  77.52 
 
 		 382 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  77.52 
 
 		 378 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  77.23 
 
 		 382 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  77.23 
 
 		 382 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  77.23 
 
 		 382 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  77.52 
 
 		 382 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  83.83 
 
 		 304 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  63.18 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  67.9 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  63.04 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  29.43 
 
 		 323 aa  99.8  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  27.5 
 
 		 318 aa  92.8  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  28.57 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  29.06 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  27.64 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  29.82 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  26.64 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  23.57 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  37.21 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  25.09 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  28.62 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  28.42 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  26.26 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  31.4 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  28.52 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  26.45 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  29.47 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  21.25 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  29.47 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  27.94 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  28.57 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  29.24 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  28.88 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  28.05 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  22.66 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  28.47 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  24.6 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  29.1 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  23.91 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  25.09 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  21.6 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  30.85 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  23.26 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  20.36 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  27.68 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  27.68 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  31.78 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  27.68 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  23.6 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  23.84 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  25.27 
 
 		 293 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  25.62 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  22.19 
 
 		 310 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  27.05 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  23.1 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  22.71 
 
 		 295 aa  53.1  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  23.49 
 
 		 290 aa  53.1  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  22.42 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  23.36 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  24.19 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  24.72 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  25.34 
 
 		 352 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  26.59 
 
 		 269 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  26.59 
 
 		 269 aa  51.6  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  25.1 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  25.1 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  24.61 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  23.14 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  21.15 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  24.24 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  19.5 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  27.4 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  25.58 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  25.09 
 
 		 269 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  24.31 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3028  GumN family protein  24.81 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  20.35 
 
 		 252 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  27.15 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1236  hypothetical protein  27.69 
 
 		 303 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  26.35 
 
 		 264 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  25.93 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1085  GCN5-related N-acetyltransferase  53.19 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0941  GCN5-related N-acetyltransferase  53.19 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.588429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>