106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3473 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  100 
 
 		 298 aa  614  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  100 
 
 		 298 aa  614  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  96.98 
 
 		 298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  83.89 
 
 		 298 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  70.47 
 
 		 299 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  69.9 
 
 		 300 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  69.67 
 
 		 300 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  69.33 
 
 		 300 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  69.23 
 
 		 300 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  50.5 
 
 		 294 aa  299  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  43.14 
 
 		 294 aa  268  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  43.05 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  44.16 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  47.18 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  43.94 
 
 		 302 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  43.38 
 
 		 303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  27.41 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  31.29 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  29.15 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  27.15 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  29.03 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  26.4 
 
 		 310 aa  92.8  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  26.5 
 
 		 476 aa  89.4  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  29.68 
 
 		 397 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  28.01 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  27.44 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  26.29 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  25.91 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  25.91 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  28.36 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  29.55 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  28.57 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  29.66 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  25.69 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  28.57 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  28.57 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  27.33 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  30 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  30 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  30 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  26.79 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  28.57 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  28.57 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  28.57 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  28.57 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  29.15 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  28.15 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  27.09 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  27.05 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  27.24 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  25.17 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  28.77 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  24.33 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  27.7 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  27.89 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  27.68 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  27.68 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  25.52 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  28.52 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  25.49 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  25.49 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  26.61 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  23.57 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  31.29 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  23.57 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  23.57 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  23.57 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  23.57 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  24.11 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  23.57 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  23.57 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  26.64 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  26.64 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  26.64 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  26.64 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  25.2 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  26.64 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  23.19 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  25.58 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  23.19 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  26.37 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  26.4 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  23.75 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  24.26 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  23.23 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3028  GumN family protein  23.85 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  24.01 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  25.84 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  24.44 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  23.88 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  24.18 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  21.55 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  23.49 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  23.81 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  20.5 
 
 		 333 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  24.54 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  20.5 
 
 		 333 aa  49.7  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2126  GumN family protein  29.66 
 
 		 1196 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  23.55 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3221  GumN family protein  23.55 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>