82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5931 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  100 
 
 		 292 aa  605  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  48.39 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  42.16 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  37.89 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  34.81 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  36.52 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  31.69 
 
 		 328 aa  159  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2155  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  27.94 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  26.69 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  26.85 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  24.43 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  27.24 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  25.44 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  26.09 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  26.09 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  23.81 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  23.81 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  25.6 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  24.33 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  22.74 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  25.75 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  22.68 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  24.36 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  21.78 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  26.48 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  24.64 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2126  GumN family protein  23.26 
 
 		 1196 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  22.57 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  24.71 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  24.11 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  25.1 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  21.88 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  31.15 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  22.68 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  25.87 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  25.87 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  22.05 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  25.83 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  23.1 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  21.07 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  23.65 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  23.68 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  25.63 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  31.78 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  31.78 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  31.78 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  31.78 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  25.47 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  32.56 
 
 		 382 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  26.72 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  24.91 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  20.74 
 
 		 371 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  27.87 
 
 		 387 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  23.55 
 
 		 476 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  24.05 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  22.75 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  31.01 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5162  hypothetical protein  32.43 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.844585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1498  hypothetical protein  32.43 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0463683  hitchhiker  0.00148753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  53.06 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  31.78 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  31.01 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  53.06 
 
 		 381 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  31.01 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  31.01 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  20.62 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  27.87 
 
 		 383 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  31.01 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  31.01 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  31.01 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  25.52 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  25.52 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  20.87 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  24.12 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1085  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0941  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.588429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  25.17 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  22.22 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  23.51 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  23.98 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  23.43 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>