77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1127 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  100 
 
 		 337 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  53.26 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  42.72 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  45.1 
 
 		 401 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  41.38 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  41.38 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  27.4 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  24.19 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  27.54 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2126  GumN family protein  30.69 
 
 		 1196 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  32.29 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  26.55 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  21.9 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  25.08 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  27.47 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  24.37 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  26.64 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  28.62 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  26.85 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  25.98 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  23.02 
 
 		 293 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  25.19 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  31.8 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  28.03 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  29.31 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  22.18 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  28.03 
 
 		 357 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  25.93 
 
 		 352 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  26.51 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  23.91 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  27.81 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  25.53 
 
 		 397 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  26.56 
 
 		 264 aa  49.3  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  26.56 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  26.4 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  26.26 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  23.72 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  20.36 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  26.4 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  26.4 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  26.4 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  22.91 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  26.56 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  26.56 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  21.71 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  26.56 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  26.56 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  26.56 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  28.74 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  22.02 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  25.39 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  43.75 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  23.48 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  23.51 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  24.08 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  25.95 
 
 		 383 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  27.53 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  27.55 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  25.1 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  27.34 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  21.71 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  23.38 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  29.73 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  29.73 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  23.38 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  23.38 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  27.34 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  26.5 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  28.85 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  23.21 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  28.39 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  28.39 
 
 		 382 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  28.39 
 
 		 382 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  20.94 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  26.74 
 
 		 264 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  24.82 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  26.92 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>