111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4096 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4096  GumN  100 
 
 
287 aa  597  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  34.96 
 
 
318 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  32.89 
 
 
476 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  34.22 
 
 
323 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  28.08 
 
 
295 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  29.66 
 
 
302 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  31.63 
 
 
312 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  31.18 
 
 
295 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  30.43 
 
 
303 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  27.72 
 
 
293 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  27.92 
 
 
310 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  26.6 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  29.35 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  28.91 
 
 
324 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  27.84 
 
 
296 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  25.94 
 
 
294 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  25.95 
 
 
293 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  27.34 
 
 
299 aa  99.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  27.78 
 
 
307 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  25.48 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  24.83 
 
 
293 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  26.95 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  31.29 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  31.29 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  26.9 
 
 
290 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  28.95 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  32.03 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  31.58 
 
 
294 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  26.42 
 
 
323 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  26.94 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  25.95 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  25.89 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  29.18 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  25.52 
 
 
357 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  24.05 
 
 
298 aa  82  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  29.33 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  26.13 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  26.13 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  28.57 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  23.66 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  28.57 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  27.4 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  28.57 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  27.08 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  23.67 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  24.64 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  24.61 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  24.64 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  25.09 
 
 
381 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  24.72 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  25.36 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  24.72 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  24.72 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  28.89 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  25.09 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  25.09 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  24.83 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  23.97 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  26.06 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  26.06 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  26.06 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  23.59 
 
 
397 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  25.71 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  25.42 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  24.9 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  24.9 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  24.9 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  24.9 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  24.9 
 
 
264 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  25.31 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  25.31 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  25.31 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  25.31 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  24.9 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  22.64 
 
 
378 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  26.55 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  24.9 
 
 
264 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  24.9 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  25.42 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3221  GumN family protein  25.56 
 
 
272 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  25.37 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  25.37 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  24.24 
 
 
383 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  24.91 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  23.99 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  23.65 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  21.53 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  23.13 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3028  GumN family protein  29.77 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  22.1 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  22.1 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  22.1 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  24.22 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  22.9 
 
 
387 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  22.1 
 
 
382 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  22.1 
 
 
382 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  22.1 
 
 
378 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  26.49 
 
 
340 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  25 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  23.83 
 
 
328 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>