89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3662 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  92.46 
 
 		 358 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  100 
 
 		 357 aa  722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  55.68 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  60.37 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  47.65 
 
 		 346 aa  322  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  47.78 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  47.57 
 
 		 333 aa  302  7.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  47.25 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  33.23 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  32.23 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  32.34 
 
 		 351 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  32.19 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6668  GumN family protein  30.7 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00152898  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  28 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  28.8 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  28.87 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  28.22 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  28.15 
 
 		 323 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  28.47 
 
 		 285 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  28.78 
 
 		 293 aa  95.9  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2126  GumN family protein  28.14 
 
 		 1196 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  29.35 
 
 		 323 aa  90.1  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  26.33 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  28.46 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  25.52 
 
 		 287 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  25.98 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  23.1 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  26.79 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  26.62 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  27.9 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  24.72 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  25.87 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  26.15 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  29.44 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  26.32 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  26.81 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  26.81 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  26.81 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  25.95 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  26.81 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  25.95 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  27.5 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2155  putative lipoprotein  25.51 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  26.45 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  21.61 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  26.45 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  22.57 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  25.72 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  26 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  27.5 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  31.44 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  31.07 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  25.09 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  27.27 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  25.86 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  25.86 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  25.86 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  25.86 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  25.86 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  25.86 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  25.86 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  23.88 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  26.76 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  24.23 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  23.82 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1236  hypothetical protein  26.77 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  29.93 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  22.53 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  23.05 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  23.84 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  28.26 
 
 		 310 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  28.03 
 
 		 337 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1084  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0940  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.571188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  24.4 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2887  GumN family protein  25.3 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  23.97 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  23.61 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  26.38 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  21.8 
 
 		 294 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  25.47 
 
 		 290 aa  46.6  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  26.74 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  26.74 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  27.31 
 
 		 269 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  25.3 
 
 		 264 aa  43.1  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  25.3 
 
 		 264 aa  43.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  25 
 
 		 264 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  25 
 
 		 264 aa  42.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  25 
 
 		 264 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>