47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2155 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2155  putative lipoprotein  100 
 
 		 296 aa  612  9.999999999999999e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  31.63 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  27.3 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  27.56 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  25.35 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  27.4 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  29.26 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  26.35 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  26.74 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  26.51 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  30.14 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  26.74 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  25.51 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  25.85 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  23.39 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  25.52 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  24.47 
 
 		 358 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  25.09 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  25.09 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  23.45 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  27.67 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  25.78 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  25.68 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  24.73 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  28.73 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  26.92 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  24.37 
 
 		 340 aa  53.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  23.38 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  25 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  22.76 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  22.74 
 
 		 328 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  31.2 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  25.54 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  26.82 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  23.33 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2126  GumN family protein  22.51 
 
 		 1196 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  27.04 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  34.33 
 
 		 397 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  37.74 
 
 		 378 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  25.78 
 
 		 381 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  35.85 
 
 		 378 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  35.85 
 
 		 382 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  35.85 
 
 		 382 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  25.78 
 
 		 381 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  25.78 
 
 		 381 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  40.74 
 
 		 383 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  25.78 
 
 		 381 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>