81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3402 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3402  GumN  100 
 
 		 346 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  49.21 
 
 		 358 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  47.42 
 
 		 335 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  48.38 
 
 		 357 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  49.37 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  47.39 
 
 		 333 aa  288  8e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  47.39 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  46.27 
 
 		 371 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  36.67 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  31.95 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  29.91 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  29.62 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6668  GumN family protein  32.04 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00152898  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  33.57 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  30.46 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  30.38 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  31.1 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  28.27 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2126  GumN family protein  30.17 
 
 		 1196 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  27.11 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  27.9 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  27.14 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  28.4 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  28.85 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2155  putative lipoprotein  30.25 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  28.06 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  24.22 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  25.36 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  28.52 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  26.13 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  26.48 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  23.51 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  25 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  27.7 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0940  hypothetical protein  34.92 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.571188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1084  hypothetical protein  34.92 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  26.92 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  25 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  24.19 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  23.47 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  21.91 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  24.92 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  24.91 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  22.47 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  28 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  26.55 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  22.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  26.5 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  26.5 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  26.5 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  25.71 
 
 		 382 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  26.5 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  26.58 
 
 		 340 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  26.58 
 
 		 340 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  27.5 
 
 		 337 aa  52.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  25.19 
 
 		 397 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  23.16 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0941  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.588429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1085  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  25.26 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  23.65 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  25.78 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  26.45 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  21.91 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  25.43 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  23.89 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  23.89 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  26.42 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  24.05 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  25.35 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  25.35 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  25.35 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  25.35 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  23.86 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  25.35 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  32.7 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  25.35 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  24.71 
 
 		 269 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  24.71 
 
 		 269 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  24.05 
 
 		 1394 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  24.62 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>