65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3411 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  100 
 
 		 307 aa  618  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  26.06 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  25.59 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  25.6 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  23.34 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  26.64 
 
 		 476 aa  86.3  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  22.06 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  24.82 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  22.91 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  25.97 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  23.93 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  24.72 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  28.57 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  25.96 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  24.72 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  25.86 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  23.19 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  22.41 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  21.99 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  24.33 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  24.33 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  24.33 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  23.45 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  23.45 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  22.93 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  19.94 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  23.62 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  21 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  24.62 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  24.72 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  23.38 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  21.09 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  24.24 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  20.14 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  20 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  20 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  20 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  21.07 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  20.71 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  20 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  20.36 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  23.2 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  22.61 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  25.1 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  24.16 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  18.55 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  20.36 
 
 		 381 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  21.18 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  23.4 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  21.77 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  18.38 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  22.76 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  22.76 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  19.78 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  19.78 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  19.78 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  19.78 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  19.78 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  19.78 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  19.78 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  20.73 
 
 		 397 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  22.39 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  21.32 
 
 		 383 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  22.39 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  23.48 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>