102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3808 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  100 
 
 		 300 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  98.67 
 
 		 300 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  98.33 
 
 		 300 aa  613  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  97.67 
 
 		 300 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  74.92 
 
 		 299 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  68.98 
 
 		 298 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  69.23 
 
 		 298 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  69.23 
 
 		 298 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  69.23 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  50.5 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  43.48 
 
 		 294 aa  278  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  43.67 
 
 		 293 aa  269  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  43.21 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  46.67 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  42.96 
 
 		 303 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  40.32 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  27.99 
 
 		 295 aa  112  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  29.78 
 
 		 323 aa  99.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  28.57 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  27.9 
 
 		 476 aa  99  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  27.99 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  25.52 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  25.52 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  26.33 
 
 		 312 aa  86.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  26.26 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  27.09 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  26.95 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  27.3 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  25.69 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  25.89 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  24.91 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  26.96 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  24.71 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  25.93 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  26.17 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  26.17 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  26.17 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  26.17 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  26.17 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  24.56 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  24.39 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  26.3 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  24.4 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  24.91 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  25.66 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  25.36 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  25.26 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  25.68 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  22.73 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  24.6 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  24.6 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  25.08 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  25.27 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  25.08 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  25.08 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  24.6 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  23.92 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  24.6 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  24.6 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  24.6 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  23.71 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  25.97 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  23.64 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  24.23 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  25.08 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  28.04 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  30.67 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  25.08 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  25.08 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  25.08 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  22.93 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  24.4 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  25.24 
 
 		 381 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  25.24 
 
 		 381 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  25.24 
 
 		 381 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3028  GumN family protein  24.71 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  24.49 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  23.08 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  23.08 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  22.67 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  24.49 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  24.05 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  24.4 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  25.48 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3221  GumN family protein  23.37 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  22.39 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  23.38 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  22.65 
 
 		 381 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  23.57 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  25.18 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  23.96 
 
 		 351 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  23.96 
 
 		 351 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  27.84 
 
 		 328 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  24.28 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  23.76 
 
 		 357 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  22.02 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  21.07 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  19.52 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  22.61 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  24.45 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>