109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2676 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2676  GumN  100 
 
 		 476 aa  976    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  32.89 
 
 		 287 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  32.28 
 
 		 312 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  30.8 
 
 		 302 aa  126  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  30.83 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  28.78 
 
 		 295 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  30.19 
 
 		 294 aa  113  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  27.4 
 
 		 295 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  26.64 
 
 		 323 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  28.89 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  28.16 
 
 		 318 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  26 
 
 		 293 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  26.26 
 
 		 294 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  25.18 
 
 		 298 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  25.09 
 
 		 302 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  24.73 
 
 		 296 aa  94.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  28.81 
 
 		 294 aa  94.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  26.59 
 
 		 310 aa  94  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  26.26 
 
 		 290 aa  93.6  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  24.65 
 
 		 311 aa  89  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  28.93 
 
 		 293 aa  87  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  26.64 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  26.57 
 
 		 299 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  25.44 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  24.91 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  24.04 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  24.51 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  25.5 
 
 		 300 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  25.5 
 
 		 300 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  29.29 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  25.5 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  25.5 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  24.55 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  27.3 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  22.15 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  24.19 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  23.93 
 
 		 310 aa  73.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  23.31 
 
 		 286 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  25.66 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  25.41 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  23.51 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  25.42 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  25.42 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  22.87 
 
 		 267 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  25.66 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  25.4 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  25.4 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  21.82 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  21.8 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  22.15 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  22.15 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  22.15 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  23.43 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  24.2 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  29.66 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  24.22 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  24.22 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  21.45 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  24.22 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  24.22 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  21.99 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  22.6 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  20.86 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  23.88 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  23.88 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  24.29 
 
 		 264 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  20.86 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  28.97 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  22.7 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  21.81 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3028  GumN family protein  22.66 
 
 		 270 aa  57  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  21.18 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  22.69 
 
 		 272 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  21.09 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  19.86 
 
 		 353 aa  54.7  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  21.09 
 
 		 381 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  23.55 
 
 		 292 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  22.52 
 
 		 300 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  20.98 
 
 		 356 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  23.05 
 
 		 328 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  20.64 
 
 		 363 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3221  GumN family protein  22.27 
 
 		 272 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  20.5 
 
 		 299 aa  51.2  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  20.79 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  27.42 
 
 		 352 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  20.19 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  22.06 
 
 		 297 aa  47  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  18.79 
 
 		 340 aa  46.6  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  18.79 
 
 		 340 aa  46.6  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  22.91 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  23.83 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  23.83 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  23.83 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  23.83 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  23.83 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  22.37 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  22.87 
 
 		 275 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  21.71 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  22.34 
 
 		 285 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  21.71 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>