87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3035 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  90.58 
 
 
381 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  90.58 
 
 
381 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  90.58 
 
 
381 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  90.58 
 
 
381 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  90.84 
 
 
381 aa  657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  90.84 
 
 
381 aa  678    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  100 
 
 
382 aa  765    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  79.89 
 
 
378 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  79.83 
 
 
382 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  79.54 
 
 
382 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  79.83 
 
 
378 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  79.83 
 
 
382 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  79.54 
 
 
382 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  79.54 
 
 
382 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  86.8 
 
 
304 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  65.49 
 
 
397 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  69.41 
 
 
383 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  65.76 
 
 
387 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  29.75 
 
 
323 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  28.21 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  29.31 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  23.95 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  27.7 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  27.9 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  29.43 
 
 
323 aa  77  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  27.27 
 
 
285 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  29.85 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  26.62 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  28.29 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  28.36 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  30.91 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  24.56 
 
 
293 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  30.55 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  29.72 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  29.72 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  25 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  30.43 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  28.73 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  24.34 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  27.57 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  24.73 
 
 
298 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  25.99 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  26.76 
 
 
299 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  27.07 
 
 
302 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  28.12 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  27.37 
 
 
401 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  29.15 
 
 
298 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  29.15 
 
 
298 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  20.21 
 
 
312 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  29.15 
 
 
298 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  24.38 
 
 
324 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  25.71 
 
 
293 aa  63.5  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  20.71 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  23 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  31.62 
 
 
328 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  27.53 
 
 
328 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  32.56 
 
 
292 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  27.34 
 
 
300 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  27.53 
 
 
335 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  24.04 
 
 
294 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  30.82 
 
 
297 aa  57  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  25 
 
 
293 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  22.71 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  24.13 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  25.91 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  25.09 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  27.24 
 
 
298 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  22.42 
 
 
290 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  24.58 
 
 
352 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  27.05 
 
 
296 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  25 
 
 
267 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  21.88 
 
 
310 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  23.81 
 
 
295 aa  53.1  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  29.64 
 
 
329 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  26.33 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  26.29 
 
 
340 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  26.29 
 
 
340 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  21.38 
 
 
286 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  20.21 
 
 
296 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  24.73 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  20.17 
 
 
252 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  24.32 
 
 
352 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  25.46 
 
 
269 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  25.46 
 
 
269 aa  46.6  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  25 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  26.71 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  24.35 
 
 
269 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>