90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3028 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  96.28 
 
 		 269 aa  530  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  96.28 
 
 		 269 aa  530  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  62.78 
 
 		 267 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  62.88 
 
 		 272 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3221  GumN family protein  60.98 
 
 		 272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  56.11 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  56.49 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  56.49 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  56.49 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  56.11 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  56.49 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  56.11 
 
 		 264 aa  301  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  56.11 
 
 		 264 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  55.73 
 
 		 264 aa  299  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  56.65 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  55.51 
 
 		 264 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  55.51 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  55.51 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  55.51 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  55.51 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  55.68 
 
 		 275 aa  280  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3028  GumN family protein  56.39 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  28.52 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  26.01 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  30.11 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  28 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  25.88 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  25.41 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  24.32 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  25 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  28.29 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  26.34 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  24 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  25.37 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  26.51 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  26.57 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  24.49 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  26.06 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  24.33 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  24.63 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  24.39 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  22.38 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  24.05 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  24.49 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  27.75 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  27.75 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  25.29 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  21.31 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  25.48 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  23.72 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  26.79 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  24.53 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  26.18 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  28.21 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  26.34 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  25.14 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  25.14 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  25.14 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  24.57 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  23.72 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  26.23 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  28.12 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2887  GumN family protein  27.69 
 
 		 252 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301907 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  23.94 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  23.45 
 
 		 252 aa  49.3  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1236  hypothetical protein  28.28 
 
 		 303 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966204 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  24.91 
 
 		 381 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  23.62 
 
 		 333 aa  48.9  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  23.62 
 
 		 333 aa  48.9  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  24.15 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  26.67 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  24.72 
 
 		 381 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  24.72 
 
 		 381 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  26.22 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  26.67 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  28.51 
 
 		 401 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  24.72 
 
 		 381 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  24.53 
 
 		 381 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  23.72 
 
 		 335 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  26.79 
 
 		 358 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  27.91 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  24.34 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  24.35 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  25.84 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  23.79 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  26.74 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  26.54 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  22.68 
 
 		 378 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  21.96 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>