67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3221 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3221  GumN family protein  100 
 
 
272 aa  551  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  93.73 
 
 
272 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  64.79 
 
 
275 aa  349  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3028  GumN family protein  67.16 
 
 
270 aa  341  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  58.65 
 
 
267 aa  332  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  61.51 
 
 
269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  61.51 
 
 
269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  60.98 
 
 
269 aa  320  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  54.58 
 
 
264 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  55.1 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  55.1 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  55.1 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  55.1 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  55.1 
 
 
264 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  52.11 
 
 
264 aa  271  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  52.11 
 
 
264 aa  271  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  52.11 
 
 
264 aa  271  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  52.11 
 
 
264 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  52.11 
 
 
264 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  52.11 
 
 
264 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  52.11 
 
 
264 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  52.11 
 
 
264 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  51.72 
 
 
264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  35.16 
 
 
298 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  31.52 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  29.75 
 
 
310 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  24.25 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  28.27 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  25.2 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  26.67 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  25.41 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  27.64 
 
 
302 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  23.46 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  23.19 
 
 
323 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  25.19 
 
 
351 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  23.64 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  24.7 
 
 
324 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  24.81 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  25.71 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  27.27 
 
 
300 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  27.27 
 
 
300 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  27.27 
 
 
300 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  22.57 
 
 
476 aa  56.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  24.11 
 
 
294 aa  55.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  18.55 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  25.87 
 
 
298 aa  52.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  24.1 
 
 
323 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  28.49 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  28.73 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  26.34 
 
 
352 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  27.27 
 
 
298 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  27.27 
 
 
298 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  27.27 
 
 
298 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  22.26 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  22.58 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  26.79 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  21.68 
 
 
294 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  23.6 
 
 
346 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  22.49 
 
 
297 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  21.14 
 
 
293 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  23.08 
 
 
328 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  22.13 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  20 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  25.4 
 
 
340 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  25.4 
 
 
340 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  25.29 
 
 
323 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  21.33 
 
 
296 aa  42.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>