85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0593 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0593  GumN  100 
 
 		 353 aa  709    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  35.54 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  35.24 
 
 		 351 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  32.12 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  33.75 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  27.81 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  29.31 
 
 		 382 aa  85.9  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  29.17 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  29.17 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  29.17 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  28.47 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  28.4 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  24.6 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  27.01 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  27.08 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  28.57 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  28.57 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  27.08 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  27.08 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  27.08 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  27.08 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  27.08 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  26.06 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  26.71 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  26.71 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  28.62 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  23.64 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  24.63 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  26.35 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  24.25 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  28.03 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  22.89 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  27.18 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  23.57 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  27.74 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  25.87 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  27.4 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  25.1 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  24.09 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  22.85 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  25.98 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  25.61 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  28.42 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  26.6 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  25.61 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  25.61 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  25.61 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  24.05 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  25.61 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  26.02 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  25.61 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  25.61 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  30.11 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  23.27 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  27.17 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  46.3 
 
 		 286 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  23.66 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  23.66 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  24.1 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  25.09 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  24.36 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  24.36 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  24.36 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  24.36 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  22.22 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  23.93 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  19.86 
 
 		 476 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  23.19 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  23.08 
 
 		 285 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  20.85 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  26.39 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  23.05 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  21.27 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  24.63 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  29.5 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  23.57 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  31.12 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  23.84 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  23.74 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  23.64 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  22.86 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6668  GumN family protein  27.52 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00152898  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  21.32 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  19.03 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  22.06 
 
 		 272 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>