47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6668 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6668  GumN family protein  100 
 
 		 340 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00152898  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  48.81 
 
 		 340 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  30.7 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  31.09 
 
 		 357 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  34.26 
 
 		 363 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  32.58 
 
 		 346 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  29.94 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  29.13 
 
 		 371 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  31.05 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  30.69 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  34.22 
 
 		 297 aa  95.9  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  30.03 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  27.08 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  25.27 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  22.14 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  25.94 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  30.06 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  26.73 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  24.39 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  27.58 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  27.58 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  21.98 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  29.23 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  27.38 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  22.74 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  21.48 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  23.05 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  27.46 
 
 		 381 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  27.46 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  27.46 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  27.46 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  22.78 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  32.75 
 
 		 329 aa  50.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2126  GumN family protein  27.68 
 
 		 1196 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  22.07 
 
 		 292 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_002950  PG2155  putative lipoprotein  25.44 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  27.51 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  25.81 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  26.62 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  19.48 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  27.56 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  23.26 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  26.87 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  28.28 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0940  hypothetical protein  25.81 
 
 		 184 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.571188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1084  hypothetical protein  25.81 
 
 		 184 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  27.3 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>