32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2126 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2126  GumN family protein  100 
 
 		 1196 aa  2459    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  28.81 
 
 		 358 aa  98.2  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  30.17 
 
 		 346 aa  91.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  28.14 
 
 		 357 aa  90.9  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  28.57 
 
 		 323 aa  89.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  27.84 
 
 		 328 aa  86.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  28.87 
 
 		 285 aa  85.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  27.18 
 
 		 286 aa  84  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  25.48 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  27.1 
 
 		 371 aa  81.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  31.01 
 
 		 337 aa  73.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  26.26 
 
 		 363 aa  72  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  24.04 
 
 		 292 aa  71.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  26.28 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  27.33 
 
 		 401 aa  64.3  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  24.74 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  24.83 
 
 		 297 aa  62.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  25 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  25.34 
 
 		 333 aa  62  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  28.29 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  24.65 
 
 		 310 aa  57.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  25.57 
 
 		 340 aa  56.2  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  25.57 
 
 		 340 aa  56.2  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  26.57 
 
 		 323 aa  53.5  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  24.46 
 
 		 363 aa  50.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  21.62 
 
 		 318 aa  50.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  25.63 
 
 		 352 aa  48.9  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  26.23 
 
 		 300 aa  47.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2155  putative lipoprotein  22.51 
 
 		 296 aa  47  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  22.92 
 
 		 397 aa  46.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  28.06 
 
 		 329 aa  46.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  20.77 
 
 		 296 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>