83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1917 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  681    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  99.4 
 
 		 333 aa  677    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  61.04 
 
 		 335 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  47.25 
 
 		 357 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  46.69 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  45.35 
 
 		 346 aa  299  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  45.99 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  45.62 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  31.99 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  30.75 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6668  GumN family protein  29.9 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00152898  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  29.88 
 
 		 351 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  29.88 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  27 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  28.23 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  28.04 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  27.86 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  27.36 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  27.86 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  25.9 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  26.3 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  26.99 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  27.66 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  23.67 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  26.58 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  25.75 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  23.16 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  25.86 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  27.04 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  24.19 
 
 		 476 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  26.98 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  27.14 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  24.57 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  26.48 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  23.49 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  23.25 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  22.91 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  29.67 
 
 		 381 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  29.67 
 
 		 381 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  25.09 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  29.67 
 
 		 381 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_002950  PG2155  putative lipoprotein  25.18 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  28.88 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  26.99 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  30.8 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  21.33 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  26.01 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  24.49 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  24.05 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2126  GumN family protein  25.34 
 
 		 1196 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  25.85 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  26.52 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  26.52 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  26.52 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  26.52 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  26.52 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  26.52 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  28.68 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  24.81 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  29.5 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  29.14 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  30.85 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  23.68 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  24.82 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  30.99 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  21.83 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  24.82 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  25.91 
 
 		 383 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  24.21 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  24.57 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  23.62 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  23.62 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  23.62 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  23.88 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  23.88 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2887  GumN family protein  24.9 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  25.87 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1236  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966204 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0940  hypothetical protein  32.79 
 
 		 184 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.571188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1084  hypothetical protein  32.79 
 
 		 184 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5162  hypothetical protein  29.79 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.844585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1498  hypothetical protein  29.79 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0463683  hitchhiker  0.00148753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>