83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3749 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  100 
 
 		 387 aa  773    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  89.92 
 
 		 383 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  74.25 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  71.78 
 
 		 378 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  62.88 
 
 		 381 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  62.34 
 
 		 381 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  62.34 
 
 		 381 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  62.34 
 
 		 381 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  67.3 
 
 		 382 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  76.03 
 
 		 378 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  63.64 
 
 		 381 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  75.71 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  75.71 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  76.03 
 
 		 382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  75.71 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  63.64 
 
 		 381 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  76.03 
 
 		 382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  76.8 
 
 		 304 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  28.36 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  26.06 
 
 		 318 aa  87.8  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  29.15 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  28.03 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  26.89 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  24.73 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  29.12 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  27.37 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  24.05 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  26.3 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  27.53 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  27.55 
 
 		 299 aa  67  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  27.34 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  28.23 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  27.37 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  29.15 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  22.7 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  26.3 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  27.5 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  27.37 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  22.74 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  29.12 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  27.74 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  28.77 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  23.94 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  28.77 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  25.72 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  25.7 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  23.1 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  23.18 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  22.9 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  26.98 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  20.97 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  25.17 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  27.87 
 
 		 292 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  24.32 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  24.26 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  26.76 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  27.21 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  27.14 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  21.99 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  25.53 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  27.11 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  25.35 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  23.53 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  24.91 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  21.48 
 
 		 290 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  24.48 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  26.38 
 
 		 337 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  27.62 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  27.62 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  25.49 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  21.4 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  25.27 
 
 		 352 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  25.82 
 
 		 275 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  23.92 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  30.6 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  22.34 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  20 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  24.74 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  20.88 
 
 		 295 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  24.09 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  24.58 
 
 		 300 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  18.71 
 
 		 286 aa  43.1  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  21.64 
 
 		 294 aa  43.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>