81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1030 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3028  GumN family protein  73 
 
 		 270 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3221  GumN family protein  64.79 
 
 		 272 aa  328  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  63.64 
 
 		 272 aa  321  8e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  59.4 
 
 		 267 aa  304  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  56.82 
 
 		 269 aa  288  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  56.82 
 
 		 269 aa  288  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  55.68 
 
 		 269 aa  280  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  55.56 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  52.11 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  52.11 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  52.11 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  52.11 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  52.11 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  52.11 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  51.72 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  51.72 
 
 		 264 aa  273  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  51.34 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  54.23 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  54.23 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  53.05 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  54.23 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  54.23 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  27.84 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  30.94 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  31.22 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  28.46 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  24.51 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  28.22 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  25.76 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  27.53 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  27.53 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  25.36 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  25.31 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  24.29 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  25 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  30.07 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  22.35 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  26.64 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  24.41 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  26.29 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  27.78 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  27.8 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  22.86 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  25.65 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  23.15 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  22.69 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  22.69 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  24.49 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  25.38 
 
 		 381 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  25.38 
 
 		 381 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  25.38 
 
 		 381 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  25.38 
 
 		 381 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  24.3 
 
 		 310 aa  49.3  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  22.22 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1236  hypothetical protein  28.79 
 
 		 303 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966204 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  26 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  26 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  25.48 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  23.74 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  24.44 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  24.62 
 
 		 378 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  24.71 
 
 		 381 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  24.71 
 
 		 381 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  26.49 
 
 		 387 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  26.38 
 
 		 401 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  22.87 
 
 		 476 aa  45.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  27.34 
 
 		 329 aa  45.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  24.73 
 
 		 382 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  24.73 
 
 		 382 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  24.73 
 
 		 382 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  28.06 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  26.09 
 
 		 383 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2887  GumN family protein  28.35 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301907 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  24.73 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  25.1 
 
 		 382 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  23.81 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  27.67 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  24.18 
 
 		 382 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  24.18 
 
 		 378 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  24.18 
 
 		 382 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>