47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1236 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1236  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.966204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2887  GumN family protein  88.89 
 
 
252 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.301907 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  32.27 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  23.24 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  30.36 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  23.17 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  28.92 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  31.82 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  24.8 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  28.02 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  34.62 
 
 
329 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  20.85 
 
 
293 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  23.87 
 
 
295 aa  58.9  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  26.64 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  26.38 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  26.77 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  31.58 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  27.5 
 
 
352 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  26.27 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  27.92 
 
 
264 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  23.05 
 
 
285 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  27.92 
 
 
264 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  27.92 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  27.92 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  27.92 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  27.92 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  30.4 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  26.07 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  28.74 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  28.74 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  26.94 
 
 
264 aa  49.7  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  26.94 
 
 
264 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  28.79 
 
 
275 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  28.34 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  27.08 
 
 
264 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  27.8 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  25.39 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  25 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  21.03 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  27.67 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  25.59 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  27.67 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  27.67 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  27.67 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  27.67 
 
 
264 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  21.58 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  21.29 
 
 
311 aa  43.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>