91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2309 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  99.43 
 
 		 351 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  704    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  80.12 
 
 		 328 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  47.13 
 
 		 352 aa  285  8e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  38.79 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  35.54 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  30.63 
 
 		 358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  31.46 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  29.62 
 
 		 346 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  29.97 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  29.27 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  27.79 
 
 		 371 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  28.57 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  28.35 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  25.74 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  28.49 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  26.26 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  23.72 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  23.81 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  25.99 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  28.07 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  24.39 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  25.81 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  26.1 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  22.6 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  25.62 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  29.12 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  29.68 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  28.72 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  28.72 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  28.72 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  26.32 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  24.11 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  29.33 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  22.38 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  27.37 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  26.67 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  25.58 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  22.46 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  26.58 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  21.2 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  28.01 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  22.81 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  26.92 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  25.8 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  20.86 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  24.73 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  25.97 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  24.04 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  34.19 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  25.1 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  25.1 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  25.1 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  25.1 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  26.52 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  24.71 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6668  GumN family protein  27.36 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00152898  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  28.1 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  25.1 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  24.32 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  22.97 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  25.66 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  24.32 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  23.79 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  24.71 
 
 		 264 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  26.22 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  26.22 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  26.22 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  26.57 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  26.22 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  26.22 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  26.22 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  25.18 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  22.26 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3221  GumN family protein  24.06 
 
 		 272 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  22.87 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  21.95 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2155  putative lipoprotein  25.54 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  23.55 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  23.55 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  23.55 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  23.55 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  23.55 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  24.33 
 
 		 269 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  24.33 
 
 		 269 aa  47  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  21.53 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  25.84 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  26.92 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  26.92 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0940  hypothetical protein  26.62 
 
 		 184 aa  42.7  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.571188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1084  hypothetical protein  26.62 
 
 		 184 aa  42.7  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>