60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5932 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  100 
 
 		 296 aa  611  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  48.39 
 
 		 292 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  29.45 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  32.46 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  29.32 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  32.85 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  25.36 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2155  putative lipoprotein  26.74 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  26.76 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  26.9 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  24.63 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  24.26 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  24.41 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  28.08 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  28.08 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  25 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  22.78 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  23.81 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  23.38 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  22.74 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  24.81 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  24.25 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  23.31 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  21.2 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  27.54 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  22.84 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  27.54 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  27.54 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  27.54 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  23.26 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  22.84 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  21.98 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  23.98 
 
 		 352 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  26.39 
 
 		 353 aa  52.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  22.54 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  26.09 
 
 		 356 aa  52.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  24.73 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  22.92 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  21.64 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  23.57 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  26.95 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  26.62 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2126  GumN family protein  21.45 
 
 		 1196 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  27.05 
 
 		 381 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  27.05 
 
 		 381 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  25.4 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  46.94 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  22.07 
 
 		 401 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  31.78 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  22.41 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  46.94 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  46.94 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  40.82 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  48.98 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  46.94 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  46.94 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  46.94 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  46.94 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1085  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0941  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.588429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>