77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0812 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  100 
 
 
286 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  34.84 
 
 
285 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  36.52 
 
 
292 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  29.01 
 
 
323 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  32.87 
 
 
286 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  32.97 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  29.01 
 
 
328 aa  112  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  27.06 
 
 
310 aa  85.9  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2126  GumN family protein  25.42 
 
 
1196 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2155  putative lipoprotein  26.51 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  27.24 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  26.41 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  25.83 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  25.18 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  25.18 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  22.94 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  22.91 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  22.71 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  25.34 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  26.16 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  22.67 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  23.19 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  33.61 
 
 
352 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  25.08 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  26.12 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  24.35 
 
 
307 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  25.08 
 
 
312 aa  58.9  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  25.35 
 
 
401 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  22.68 
 
 
293 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  20.61 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  22.22 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  46.3 
 
 
353 aa  57  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  25 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  24.1 
 
 
371 aa  56.2  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  25.56 
 
 
311 aa  56.2  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  22.53 
 
 
357 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  25.1 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  22.97 
 
 
351 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  22.41 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  22.97 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  23.74 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  23.6 
 
 
381 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  23.77 
 
 
381 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  23.6 
 
 
381 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  23.6 
 
 
381 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  25.39 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  23.55 
 
 
363 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  21.83 
 
 
299 aa  52.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  23.22 
 
 
381 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  23.4 
 
 
381 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  19.5 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  22.26 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  23.59 
 
 
340 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1085  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0941  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.588429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  22.31 
 
 
324 aa  49.7  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  20.77 
 
 
293 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  22.82 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  24.19 
 
 
378 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  24.91 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  44.9 
 
 
382 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  44.9 
 
 
382 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  44.9 
 
 
382 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  19.51 
 
 
298 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  44.9 
 
 
304 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  21.71 
 
 
337 aa  45.8  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  36.92 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  23.83 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  44.9 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  44.9 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  44.9 
 
 
378 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  44.9 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  23.39 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  25.09 
 
 
476 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  20.3 
 
 
356 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  36.92 
 
 
383 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  22.14 
 
 
329 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>