73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2380 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  100 
 
 		 340 aa  662    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6668  GumN family protein  50.16 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00152898  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  34.22 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  36.67 
 
 		 346 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  34.77 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2934  GumN family protein  35.09 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  33.01 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  32.17 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  32.36 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3662  GumN family protein  32.27 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  34.58 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  29.08 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  29.17 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  29.38 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  29.59 
 
 		 356 aa  92.4  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  22.9 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  27.27 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  27.53 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  29.86 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  27.74 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  29.43 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  26.53 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  23.1 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  24.21 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  27.76 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  26.91 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  28.66 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  25.71 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  27.36 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  27.19 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  27.36 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  27.36 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  27.03 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  24.92 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  27.57 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2155  putative lipoprotein  24.37 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  26.49 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  27.24 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  28.48 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  24.82 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  26.89 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  26.89 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  26.89 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  28.4 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  27.48 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  26.89 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  26.89 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  26.89 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  26.89 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  27.06 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  25.6 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  32.35 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  26.57 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  29.41 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  25.17 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  27.08 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  30.1 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  22.37 
 
 		 476 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5932  GumN family protein  22.18 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350873  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  30.45 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  21.31 
 
 		 312 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1084  hypothetical protein  28.93 
 
 		 184 aa  50.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  23.62 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0940  hypothetical protein  28.93 
 
 		 184 aa  50.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.571188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  28.24 
 
 		 363 aa  49.7  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  25.17 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  25.17 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  20.79 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  26.17 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  33.82 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  26.55 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2126  GumN family protein  47.83 
 
 		 1196 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  25.1 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>