82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1616 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1616  GumN  100 
 
 		 299 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  34.93 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  34.34 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  33.69 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  32.08 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  32.61 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  30.56 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  26.62 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  29.62 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  25.32 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  28.43 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  27.03 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  32.14 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  38.82 
 
 		 329 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  27.7 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  24.65 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5931  GumN family protein  22.68 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.744768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  27.92 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  25.77 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  22.74 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  27.57 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1236  hypothetical protein  28.29 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.966204 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  32.24 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  32.24 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  26.62 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  29.92 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  28.67 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0812  GumN family protein  22.22 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  24.83 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  27.46 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  26.62 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  26.62 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  26.92 
 
 		 382 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  26.92 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  26.92 
 
 		 378 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  26.92 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  26.92 
 
 		 382 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  26.92 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  29.53 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3396  GumN family protein  27.61 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  25.09 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  30.99 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  24.66 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  30.99 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  25.41 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  26.47 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  26.47 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  26.47 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  26.47 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  22.53 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  26.15 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  26.38 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  26.38 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  20.57 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  25.9 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  23.18 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  26.59 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  19.21 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6313  GumN family protein  28.12 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  28.97 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  20.5 
 
 		 476 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  31.54 
 
 		 401 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2887  GumN family protein  25.21 
 
 		 252 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.301907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  26.01 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  25.61 
 
 		 356 aa  49.3  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  20.42 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  34.52 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  26.29 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  30.39 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  26.32 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  33.33 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  33.33 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  34.06 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3656  GumN family protein  27.18 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  31.88 
 
 		 358 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  22.11 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  25.42 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  28.91 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  32.18 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0743  GumN family protein  27.39 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  32.59 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>