61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1052 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  41.27 
 
 
312 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  29.29 
 
 
476 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  24.61 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  27.4 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  29.51 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  23.65 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3411  GumN family protein  27.1 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  20.63 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  25.56 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  25.36 
 
 
324 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  25.65 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  22.73 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  20.91 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  22.27 
 
 
300 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  23.96 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  23.96 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  22.27 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  22.27 
 
 
300 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  22.77 
 
 
295 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  22.75 
 
 
294 aa  55.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  24.44 
 
 
298 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  24.44 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  24.44 
 
 
298 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  20.6 
 
 
323 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3749  GumN family protein  22.28 
 
 
387 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.972239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  20 
 
 
318 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2909  GumN family protein  23.59 
 
 
397 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  20.92 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  22.99 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0187  hypothetical protein  20.94 
 
 
383 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  23.04 
 
 
294 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  22.76 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  22.76 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  23.45 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  20 
 
 
296 aa  48.9  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  22.61 
 
 
298 aa  48.9  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0225  GumN family protein  21.99 
 
 
378 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  20.59 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  20.59 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  20.59 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  20.59 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  20.59 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3035  GumN family protein  21.47 
 
 
382 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2535  GumN  23.68 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0181444  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  23.39 
 
 
381 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  23.39 
 
 
381 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  21.14 
 
 
293 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  18.52 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1567  GumN family protein  23.74 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000169985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3221  GumN family protein  20.29 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2974  GumN family protein  29.85 
 
 
382 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.562874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2116  GumN family protein  29.85 
 
 
382 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0261  GumN family protein  29.85 
 
 
378 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3373  GumN family protein  29.85 
 
 
382 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3306  GumN family protein  29.85 
 
 
304 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0248  GumN family protein  29.85 
 
 
382 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.49134  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0443  GumN family protein  29.85 
 
 
382 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  24.14 
 
 
302 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  21.08 
 
 
310 aa  42  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  19.05 
 
 
264 aa  42  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>