144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0676 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0676  cytochrome c1  100 
 
 		 271 aa  557  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140638  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1394  cytochrome c1  64.49 
 
 		 280 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  55 
 
 		 269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2164  cytochrome c1  44.4 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497281  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  46.06 
 
 		 252 aa  198  7.999999999999999e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3203  cytochrome c1  39.19 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  41.37 
 
 		 251 aa  188  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3040  cytochrome c1  44.31 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2776  cytochrome c1  43.53 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1539  cytochrome c1  40.14 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2244  cytochrome c1  43.65 
 
 		 262 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400916  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_004310  BR1541  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1, putative  41.05 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  42.19 
 
 		 688 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1625  cytochrome c1  42.19 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1490  putative ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  41.05 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.531378  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  39.83 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  43.21 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6796  cytochrome c1  40.94 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.866248  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0703  cytochrome c1  42.31 
 
 		 284 aa  171  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  40.93 
 
 		 690 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7535  cytochrome c1  40.55 
 
 		 298 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  42.32 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  39.08 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  39.45 
 
 		 687 aa  165  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0465  cytochrome c1  37.79 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0626  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  37.55 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.415478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  37.89 
 
 		 689 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2307  cytochrome c1  40.16 
 
 		 450 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  decreased coverage  0.0079978 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00630  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  41.1 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0899568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2767  cytochrome c1  37.41 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2801  cytochrome c1  38.46 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.824407  normal  0.36289 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28125  predicted protein  44.2 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138363  normal  0.0229296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2544  cytochrome c1  39.84 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  36.72 
 
 		 689 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  38.22 
 
 		 688 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26515  predicted protein  38.24 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00357  Ubiquinol-cytochrome c reductase (Eurofung)  39.37 
 
 		 316 aa  153  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1394  cytochrome c1 precursor  37.69 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0061  cytochrome c1  37.69 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.197339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  35.27 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86147  cytochrome c1  40 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  33.45 
 
 		 688 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  37.75 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3276  cytochrome c1  39.04 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2472  cytochrome c1  38.5 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.546369  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0327  cytochrome c1  38.98 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0277  cytochrome c1  36.96 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2812  cytochrome c1  37.4 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2946  cytochrome c1  36.89 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  30.14 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  29.22 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  29.22 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  28.77 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  28.77 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  29.22 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  28.38 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  28.77 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  29.22 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  31.39 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  30.53 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  28.31 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  30.59 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  28.89 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  29.02 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  30 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  30.77 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00439  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  32.14 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  33.33 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0811  cytochrome c1  28.45 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000393598  hitchhiker  0.0000113285 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1140  cytochrome c1  29.39 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0717268  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1943  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  30.25 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.810872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  28.05 
 
 		 747 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1363  cytochrome c1  30.04 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1878  cytochrome c1  29.83 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  27.35 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2631  hypothetical protein  28.38 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  25.86 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  25 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  26.41 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  26.87 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2758  hypothetical protein  27.93 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  25.53 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  25.21 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0107  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  24.68 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00110393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00885  ubiquinol-cytochrome c reductase  25.22 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1960  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  28.32 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3699  cytochrome c1  28.33 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201159  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2731  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  26.94 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0309003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2353  cytochrome c1  26.94 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.922589  hitchhiker  0.000000000801731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2927  putative cytochrome C1 precursor transmembrane protein  26.99 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  27.6 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13080  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  24.8 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2709  cytochrome c1  26.01 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000107976  unclonable  0.0000000000354845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3111  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  26.01 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  25.42 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0791  cytochrome c1  24.89 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  24.65 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  26.82 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2872  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  26.55 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2468  cytochrome c1  25.42 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0366705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>