140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86147 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_86147  cytochrome c1  100 
 
 		 288 aa  598  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.216039 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00357  Ubiquinol-cytochrome c reductase (Eurofung)  64.52 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00630  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  70.16 
 
 		 320 aa  375  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0899568  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28125  predicted protein  60.34 
 
 		 251 aa  279  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138363  normal  0.0229296 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26515  predicted protein  52.79 
 
 		 272 aa  255  6e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  44.22 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  47.75 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  46.22 
 
 		 690 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  41.1 
 
 		 689 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  42.35 
 
 		 689 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  44.14 
 
 		 252 aa  198  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6796  cytochrome c1  40.22 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.866248  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7535  cytochrome c1  41.67 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2164  cytochrome c1  42.25 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497281  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0626  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  49.55 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.415478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  40.71 
 
 		 687 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  42.26 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  43.56 
 
 		 688 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  41.46 
 
 		 688 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  42.46 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2244  cytochrome c1  43.75 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400916  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  43.12 
 
 		 688 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  42.08 
 
 		 297 aa  178  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  43.19 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0703  cytochrome c1  43.4 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  36.63 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3203  cytochrome c1  39.76 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0277  cytochrome c1  42.08 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0465  cytochrome c1  39.45 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2544  cytochrome c1  37.94 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2767  cytochrome c1  37.94 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1625  cytochrome c1  42.74 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1541  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1, putative  40.21 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1490  putative ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  40.21 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.531378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1394  cytochrome c1  43.57 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1539  cytochrome c1  36.73 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2776  cytochrome c1  39.21 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3040  cytochrome c1  37.2 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0676  cytochrome c1  40 
 
 		 271 aa  152  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2472  cytochrome c1  40.43 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.546369  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2946  cytochrome c1  37.5 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2307  cytochrome c1  34.13 
 
 		 450 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  decreased coverage  0.0079978 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0327  cytochrome c1  36.44 
 
 		 269 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1394  cytochrome c1 precursor  34.09 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0061  cytochrome c1  34.09 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.197339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3276  cytochrome c1  36.55 
 
 		 264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  32.4 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2801  cytochrome c1  30.74 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.824407  normal  0.36289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2812  cytochrome c1  32.68 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  25.51 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  25.51 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  25.97 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1960  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  29.31 
 
 		 240 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  25 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  24.29 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  25 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  25 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  25 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  24.78 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  24.78 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  25.4 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  24.9 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  26.11 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  26.32 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1140  cytochrome c1  23.91 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0717268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  26.32 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  24.89 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  23.18 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  23.81 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  26.29 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2927  putative cytochrome C1 precursor transmembrane protein  22.51 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  23.19 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  23.46 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  23.55 
 
 		 250 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  25.44 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  26.89 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  22.78 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  23.18 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  26.98 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  22.36 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  24.05 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0416  putative cytochrome C1 transmembrane protein  24.23 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5501  cytochrome c1  23.65 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0361  cytochrome c1  23.31 
 
 		 252 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278917  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3542  cytochrome c1  24.23 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608845  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1943  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  26.02 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.810872  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3111  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  26.01 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2709  cytochrome c1  26.01 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000107976  unclonable  0.0000000000354845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00439  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  23.4 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3694  cytochrome c1  23.24 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1807  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.73 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216061  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1878  cytochrome c1  25.51 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0370  cytochrome c1  22.88 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2696  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.73 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3673  cytochrome c1 precursor  23.73 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3541  cytochrome c1  22.88 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2209  cytochrome c1  25.22 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3258  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.73 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3648  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.73 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3705  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.73 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>