144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0362 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  44.91 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  45.45 
 
 		 689 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  44.94 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  45.26 
 
 		 689 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2164  cytochrome c1  46.48 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7535  cytochrome c1  44.13 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6796  cytochrome c1  44.48 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.866248  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  43.32 
 
 		 690 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2244  cytochrome c1  46.4 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400916  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  44.26 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  45.8 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0465  cytochrome c1  43.9 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  42.61 
 
 		 688 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  42.56 
 
 		 285 aa  211  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  45.52 
 
 		 688 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00630  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  41.55 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0899568  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86147  cytochrome c1  42.46 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  44.18 
 
 		 687 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00357  Ubiquinol-cytochrome c reductase (Eurofung)  43.6 
 
 		 316 aa  203  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  42.01 
 
 		 688 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3203  cytochrome c1  43.58 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2767  cytochrome c1  43 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2544  cytochrome c1  44.37 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1541  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1, putative  44.48 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1490  putative ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  44.48 
 
 		 318 aa  195  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.531378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1625  cytochrome c1  44.6 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0703  cytochrome c1  41.43 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1539  cytochrome c1  41.2 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28125  predicted protein  42.62 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138363  normal  0.0229296 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0626  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  41.96 
 
 		 256 aa  191  2e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.415478  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26515  predicted protein  41.82 
 
 		 272 aa  189  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  40.89 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0277  cytochrome c1  42.44 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1394  cytochrome c1  42.59 
 
 		 280 aa  184  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3040  cytochrome c1  42.86 
 
 		 294 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  42.32 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0676  cytochrome c1  43.15 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2776  cytochrome c1  38.93 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2472  cytochrome c1  44.58 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.546369  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2307  cytochrome c1  37.13 
 
 		 450 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  decreased coverage  0.0079978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  34.8 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1394  cytochrome c1 precursor  38.2 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0061  cytochrome c1  38.2 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.197339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0327  cytochrome c1  36.72 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2801  cytochrome c1  35.74 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.824407  normal  0.36289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2812  cytochrome c1  34.85 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3276  cytochrome c1  35.99 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2946  cytochrome c1  37.38 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  31.64 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  31.64 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  32.64 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2927  putative cytochrome C1 precursor transmembrane protein  29.67 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  30.17 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  30.07 
 
 		 255 aa  89  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2696  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  31.67 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3673  cytochrome c1 precursor  31.67 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  26.23 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3258  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  31.67 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1807  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  31.67 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3648  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  31.67 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3705  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  31.67 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2746  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  31.67 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5501  cytochrome c1  25.96 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2975  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  31.25 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.674351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  30.74 
 
 		 241 aa  85.9  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0346  cytochrome c1  28.72 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3694  cytochrome c1  26.39 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3541  cytochrome c1  28.95 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0137  cytochrome c1  27.76 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.148946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2741  cytochrome c1  29.41 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  27.35 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2664  cytochrome c1  29.58 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0422  cytochrome c1  29.58 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674989  hitchhiker  0.0000052369 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0443  cytochrome c1  29.58 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0370  cytochrome c1  28.51 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0361  cytochrome c1  28.51 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278917  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  27.94 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  27.87 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0416  putative cytochrome C1 transmembrane protein  28.07 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0791  cytochrome c1  25.93 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0754  cytochrome c1  25.93 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  25.94 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  28.09 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  27.31 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0811  cytochrome c1  26.97 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000393598  hitchhiker  0.0000113285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  27.95 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  23.96 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3542  cytochrome c1  27.19 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608845  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  28.03 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  27.21 
 
 		 231 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0823  cytochrome c1  27.34 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.862192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  29.22 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  29.22 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0715  cytochrome c1  25.7 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  28.4 
 
 		 232 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  28.4 
 
 		 232 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  27.57 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  28.57 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1140  cytochrome c1  27.66 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0717268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>