98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2946 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2946  cytochrome c1  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2244  cytochrome c1  41.01 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400916  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  35.47 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  37.66 
 
 		 689 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  37.56 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2164  cytochrome c1  37.18 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497281  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  35.11 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26515  predicted protein  36.49 
 
 		 272 aa  143  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  36.13 
 
 		 689 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  36.89 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  36.88 
 
 		 690 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86147  cytochrome c1  36.55 
 
 		 288 aa  139  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28125  predicted protein  40.28 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138363  normal  0.0229296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7535  cytochrome c1  37.05 
 
 		 298 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6796  cytochrome c1  36.48 
 
 		 298 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.866248  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  38.62 
 
 		 688 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2767  cytochrome c1  38.81 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0277  cytochrome c1  39.41 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  36.58 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1394  cytochrome c1  38.67 
 
 		 280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2544  cytochrome c1  38.81 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3203  cytochrome c1  36.28 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  38.4 
 
 		 687 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  35.59 
 
 		 285 aa  131  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00630  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  35.58 
 
 		 320 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0899568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  37.66 
 
 		 688 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  36.29 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0703  cytochrome c1  36.29 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403643  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00357  Ubiquinol-cytochrome c reductase (Eurofung)  38.65 
 
 		 316 aa  128  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  34.08 
 
 		 688 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  38.6 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0676  cytochrome c1  37.91 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0465  cytochrome c1  32.54 
 
 		 302 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1625  cytochrome c1  37.89 
 
 		 290 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1539  cytochrome c1  36.61 
 
 		 289 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1490  putative ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  36.6 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.531378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1541  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1, putative  36.6 
 
 		 295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2472  cytochrome c1  36.36 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.546369  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3040  cytochrome c1  35.45 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2776  cytochrome c1  35.45 
 
 		 294 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0626  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  34.73 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.415478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0061  cytochrome c1  34.57 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.197339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1394  cytochrome c1 precursor  34.57 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0327  cytochrome c1  34.58 
 
 		 269 aa  101  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2812  cytochrome c1  34.82 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2801  cytochrome c1  33.45 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.824407  normal  0.36289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2307  cytochrome c1  35.48 
 
 		 450 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  decreased coverage  0.0079978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3276  cytochrome c1  35.94 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  26.55 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  25.69 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0422  cytochrome c1  25.66 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674989  hitchhiker  0.0000052369 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0443  cytochrome c1  25.66 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2664  cytochrome c1  25.66 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756907  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0346  cytochrome c1  28.19 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3542  cytochrome c1  25.57 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608845  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5501  cytochrome c1  26.04 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3541  cytochrome c1  24.91 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  26.94 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  26.94 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2741  cytochrome c1  26.12 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  27.42 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2927  putative cytochrome C1 precursor transmembrane protein  25.19 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  25.59 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2746  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.56 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2696  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.56 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3258  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.56 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3705  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.56 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3648  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.56 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1807  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.65 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216061  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3673  cytochrome c1 precursor  25.56 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  26.79 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0361  cytochrome c1  22.97 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  26.23 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2975  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.19 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.674351  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0370  cytochrome c1  22.52 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0811  cytochrome c1  26.19 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000393598  hitchhiker  0.0000113285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  26.36 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  25.93 
 
 		 231 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  25.82 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  25.3 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  25.96 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  26.72 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  24.35 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  25.48 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1585  cytochrome c1  27.51 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3694  cytochrome c1  26.01 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  24.7 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0715  cytochrome c1  24.91 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  22.73 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1422  ubiquinol cytochrome c1 reductase  26.46 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00068249  normal  0.213297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  24.3 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  23.97 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0137  cytochrome c1  23.16 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.148946 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0791  cytochrome c1  23.08 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0754  cytochrome c1  23.08 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0823  cytochrome c1  24.81 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.862192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13080  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.22 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  20.91 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>