98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2472 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2472  cytochrome c1  100 
 
 		 307 aa  631  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.546369  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2544  cytochrome c1  89.71 
 
 		 297 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2767  cytochrome c1  90.07 
 
 		 297 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0465  cytochrome c1  64.55 
 
 		 302 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7535  cytochrome c1  61.74 
 
 		 298 aa  334  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6796  cytochrome c1  62.5 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.866248  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  55.39 
 
 		 689 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  52.07 
 
 		 689 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  53.74 
 
 		 687 aa  269  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  51.24 
 
 		 690 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  55.64 
 
 		 688 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  54.74 
 
 		 688 aa  262  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  53.76 
 
 		 688 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  50.58 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  53.15 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2164  cytochrome c1  54.39 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3203  cytochrome c1  50.18 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2776  cytochrome c1  49.82 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1539  cytochrome c1  50 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3040  cytochrome c1  54.08 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2244  cytochrome c1  45.91 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400916  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1625  cytochrome c1  48.94 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1541  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1, putative  48.23 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1490  putative ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  48.4 
 
 		 318 aa  196  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.531378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0703  cytochrome c1  40.5 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  37.55 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  39.06 
 
 		 269 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  38.8 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  43.43 
 
 		 272 aa  162  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86147  cytochrome c1  38.58 
 
 		 288 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  36.25 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28125  predicted protein  40.69 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138363  normal  0.0229296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  41.05 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26515  predicted protein  37.97 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2307  cytochrome c1  40.25 
 
 		 450 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  decreased coverage  0.0079978 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00630  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  35.71 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0899568  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00357  Ubiquinol-cytochrome c reductase (Eurofung)  37.5 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0277  cytochrome c1  41.33 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0327  cytochrome c1  37.91 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1394  cytochrome c1  41.77 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0676  cytochrome c1  37.04 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140638  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2812  cytochrome c1  39.38 
 
 		 263 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3276  cytochrome c1  39.78 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1394  cytochrome c1 precursor  37.08 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0061  cytochrome c1  37.08 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.197339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0626  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  33.56 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.415478  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2946  cytochrome c1  36.36 
 
 		 243 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  30.14 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2801  cytochrome c1  34.44 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.824407  normal  0.36289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4252  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00439  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  25.43 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  23.57 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  23.85 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  24.11 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  23.85 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  23.85 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  24.11 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  24.11 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  23.39 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  23.39 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  23.39 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.23 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  24.55 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  22.94 
 
 		 233 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1943  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  24.02 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.810872  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0715  cytochrome c1  25 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1878  cytochrome c1  24.02 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1363  cytochrome c1  25.82 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  23.85 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  22.35 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0416  putative cytochrome C1 transmembrane protein  25.22 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  22.48 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2664  cytochrome c1  25.94 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0422  cytochrome c1  25.94 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674989  hitchhiker  0.0000052369 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0443  cytochrome c1  25.94 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  22.67 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  25.4 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  25 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3542  cytochrome c1  24.68 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608845  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3694  cytochrome c1  22.5 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  24.18 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0811  cytochrome c1  24.34 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000393598  hitchhiker  0.0000113285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  25.81 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5501  cytochrome c1  22.67 
 
 		 251 aa  46.2  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0791  cytochrome c1  23.58 
 
 		 251 aa  45.8  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  21.22 
 
 		 240 aa  46.2  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0754  cytochrome c1  23.58 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  25.69 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0361  cytochrome c1  26.38 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  22.51 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  24 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0370  cytochrome c1  24.59 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3541  cytochrome c1  24.59 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  23.68 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0346  cytochrome c1  26.81 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  23.27 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2975  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.58 
 
 		 252 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.674351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1202  cytochrome c1  26.24 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>