144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0356 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2164  cytochrome c1  34.47 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  35.55 
 
 		 690 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  35.81 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  33.33 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  33.45 
 
 		 689 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  33.1 
 
 		 689 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0676  cytochrome c1  37.75 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  34.08 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1625  cytochrome c1  35.88 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2244  cytochrome c1  32.67 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400916  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1394  cytochrome c1  36.58 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  31.38 
 
 		 688 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3040  cytochrome c1  35.12 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1541  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1, putative  34.55 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2767  cytochrome c1  31.05 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1490  putative ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  34.55 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.531378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  33.33 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2544  cytochrome c1  31.05 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2776  cytochrome c1  33.77 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3203  cytochrome c1  33.22 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3276  cytochrome c1  34.3 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7535  cytochrome c1  33.33 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6796  cytochrome c1  32.96 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.866248  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0703  cytochrome c1  35.45 
 
 		 284 aa  138  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  32.42 
 
 		 688 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  34.15 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2307  cytochrome c1  31.91 
 
 		 450 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  decreased coverage  0.0079978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0465  cytochrome c1  32.85 
 
 		 302 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  31.68 
 
 		 687 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  30.16 
 
 		 688 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  32.95 
 
 		 251 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  31.44 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1394  cytochrome c1 precursor  32.96 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  32.22 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0061  cytochrome c1  32.96 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.197339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2801  cytochrome c1  32.21 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.824407  normal  0.36289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0327  cytochrome c1  31.31 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28125  predicted protein  32.46 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138363  normal  0.0229296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1539  cytochrome c1  32.82 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0277  cytochrome c1  31.54 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0626  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  32.1 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.415478  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00630  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  30.39 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0899568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2812  cytochrome c1  30.55 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2472  cytochrome c1  30.48 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.546369  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86147  cytochrome c1  32.4 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26515  predicted protein  29.85 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00357  Ubiquinol-cytochrome c reductase (Eurofung)  31.52 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  29.22 
 
 		 747 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  26.76 
 
 		 242 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  27.34 
 
 		 250 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  26.69 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  26.64 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2741  cytochrome c1  27.5 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  24.72 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  25.47 
 
 		 241 aa  85.5  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2927  putative cytochrome C1 precursor transmembrane protein  25.09 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  25.63 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  25.4 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  25.09 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1003  cytochrome c1  26.16 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0835319  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  26.18 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  26.18 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  26.18 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1960  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  26.5 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  23.76 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0811  cytochrome c1  23.83 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000393598  hitchhiker  0.0000113285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  25 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0416  putative cytochrome C1 transmembrane protein  25.65 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  25.45 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  25.45 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  25.71 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1363  cytochrome c1  28.75 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  25.86 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  25.42 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13080  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.38 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  25.09 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  25.1 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2209  cytochrome c1  28.04 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00439  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  26.36 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  25.96 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0926  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.67 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  25.32 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0715  cytochrome c1  25.21 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.67 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  24.81 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3542  cytochrome c1  24.78 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608845  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4530  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.61 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.490677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4405  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  24.38 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3541  cytochrome c1  24 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57540  putative cytochrome c1 precursor  23.75 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5001  putative cytochrome c1 precursor  23.75 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0905  cytochrome c1-like protein  24.03 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.111251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2664  cytochrome c1  23.64 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0443  cytochrome c1  23.64 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0422  cytochrome c1  23.64 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674989  hitchhiker  0.0000052369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2975  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  24.64 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.674351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1202  cytochrome c1  23.19 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  23.62 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5501  cytochrome c1  23.21 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>