143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0823 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0823  cytochrome c1  100 
 
 		 255 aa  534  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.862192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0715  cytochrome c1  82.35 
 
 		 251 aa  454  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3694  cytochrome c1  74.9 
 
 		 251 aa  421  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5501  cytochrome c1  74.12 
 
 		 251 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  75.65 
 
 		 253 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0754  cytochrome c1  73.33 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0791  cytochrome c1  73.33 
 
 		 251 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  70.94 
 
 		 257 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1202  cytochrome c1  68.87 
 
 		 257 aa  359  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  68.91 
 
 		 255 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  60.78 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  58.43 
 
 		 247 aa  309  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0932  cytochrome c1  61.3 
 
 		 260 aa  308  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2975  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  57.75 
 
 		 252 aa  308  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.674351  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2696  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  57.36 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3258  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  57.36 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2746  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  57.36 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3673  cytochrome c1 precursor  57.36 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1807  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  57.36 
 
 		 259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3648  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  57.36 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3705  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  57.36 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0346  cytochrome c1  56.59 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2927  putative cytochrome C1 precursor transmembrane protein  57.92 
 
 		 248 aa  298  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3541  cytochrome c1  55.43 
 
 		 252 aa  298  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2664  cytochrome c1  55.81 
 
 		 252 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0443  cytochrome c1  55.81 
 
 		 252 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0422  cytochrome c1  55.81 
 
 		 252 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674989  hitchhiker  0.0000052369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3542  cytochrome c1  55.64 
 
 		 251 aa  297  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608845  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2741  cytochrome c1  54.86 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0370  cytochrome c1  56.2 
 
 		 252 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  57.42 
 
 		 247 aa  294  8e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0361  cytochrome c1  56.2 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278917  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  57.42 
 
 		 247 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0416  putative cytochrome C1 transmembrane protein  53.7 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  56.1 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0137  cytochrome c1  55.69 
 
 		 257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.148946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  50.4 
 
 		 241 aa  247  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  50.67 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1003  cytochrome c1  52.56 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0835319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0811  cytochrome c1  46.48 
 
 		 239 aa  234  8e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000393598  hitchhiker  0.0000113285 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  44.44 
 
 		 250 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00885  ubiquinol-cytochrome c reductase  44.14 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  43.36 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  39.92 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  42.02 
 
 		 245 aa  205  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0107  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  41.02 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00110393  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  39.85 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2872  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  40 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3699  cytochrome c1  42.35 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201159  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  41.96 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  41.96 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  42.35 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  42.35 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  41.57 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  40.39 
 
 		 231 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1363  cytochrome c1  40.49 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  40 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  41.18 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  40.78 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  40.78 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2758  hypothetical protein  38.49 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2631  hypothetical protein  38.1 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00439  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  43.18 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0926  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  36.06 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4530  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  37.55 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.490677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  40.7 
 
 		 244 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4405  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  36 
 
 		 259 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  36 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0905  cytochrome c1-like protein  36.9 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.111251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  36.43 
 
 		 747 aa  175  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13080  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  36.9 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  39.22 
 
 		 232 aa  175  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  39.45 
 
 		 233 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4690  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  36.73 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.0239811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5001  putative cytochrome c1 precursor  34.91 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  38.82 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57540  putative cytochrome c1 precursor  34.91 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  38.28 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  35.27 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1960  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  36.82 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1943  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  40.34 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.810872  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2468  cytochrome c1  38.31 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0366705  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1878  cytochrome c1  40.34 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  38.28 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2209  cytochrome c1  35.91 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1140  cytochrome c1  39.13 
 
 		 252 aa  158  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0717268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4438  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  38.08 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.581473  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1422  ubiquinol cytochrome c1 reductase  35.39 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00068249  normal  0.213297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1585  cytochrome c1  34.98 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0794  cytochrome c1  35.68 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0108816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2731  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  33.46 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0309003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2353  cytochrome c1  33.46 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.922589  hitchhiker  0.000000000801731 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2709  cytochrome c1  29.27 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000107976  unclonable  0.0000000000354845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3111  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  29.27 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  31.52 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  26.59 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03201  putative ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  37.14 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000484188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  25.26 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  25.74 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  26.19 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>