142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6796 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6796  cytochrome c1  100 
 
 		 298 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.866248  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7535  cytochrome c1  91.92 
 
 		 298 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0465  cytochrome c1  71.96 
 
 		 302 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2544  cytochrome c1  67 
 
 		 297 aa  391  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2767  cytochrome c1  67 
 
 		 297 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  55.44 
 
 		 689 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  60.73 
 
 		 688 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  55.16 
 
 		 689 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  56.6 
 
 		 687 aa  323  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  54.77 
 
 		 690 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2472  cytochrome c1  62.65 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.546369  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  53.71 
 
 		 688 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  57.88 
 
 		 688 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  54.2 
 
 		 285 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2164  cytochrome c1  56.47 
 
 		 281 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497281  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  56.44 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3203  cytochrome c1  51.57 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2776  cytochrome c1  53.02 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1541  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1, putative  56.47 
 
 		 295 aa  258  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1490  putative ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  56.47 
 
 		 318 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.531378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1625  cytochrome c1  56.47 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2244  cytochrome c1  48.41 
 
 		 262 aa  251  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400916  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3040  cytochrome c1  56.69 
 
 		 294 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1539  cytochrome c1  50.86 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  41.55 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  41.9 
 
 		 252 aa  219  6e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  44.44 
 
 		 272 aa  212  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  40.36 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0703  cytochrome c1  40.76 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403643  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00630  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  41.29 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0899568  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86147  cytochrome c1  40.07 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  41.8 
 
 		 269 aa  199  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28125  predicted protein  44.53 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138363  normal  0.0229296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  42.86 
 
 		 269 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2307  cytochrome c1  43.87 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  decreased coverage  0.0079978 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26515  predicted protein  41.57 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00357  Ubiquinol-cytochrome c reductase (Eurofung)  38.11 
 
 		 316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1394  cytochrome c1 precursor  41.91 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0061  cytochrome c1  41.91 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.197339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0676  cytochrome c1  39.72 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140638  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2801  cytochrome c1  39.34 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.824407  normal  0.36289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1394  cytochrome c1  39.93 
 
 		 280 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0626  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  37.68 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.415478  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0277  cytochrome c1  42.46 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0327  cytochrome c1  41.06 
 
 		 269 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3276  cytochrome c1  38.75 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2812  cytochrome c1  39.52 
 
 		 263 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  32.12 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2946  cytochrome c1  34.11 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  29.15 
 
 		 232 aa  93.2  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  28.74 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  28.34 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  27.4 
 
 		 231 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  28.34 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  28.34 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  28.34 
 
 		 231 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  28.34 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  28.34 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  27.94 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  28.34 
 
 		 233 aa  90.5  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  26.72 
 
 		 233 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  27.94 
 
 		 232 aa  89.7  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  27.5 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  27.41 
 
 		 244 aa  87  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  26.32 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  26.07 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00439  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  28.96 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  29.2 
 
 		 241 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1363  cytochrome c1  29.23 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  24.61 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  22.6 
 
 		 242 aa  72  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1960  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  24.9 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  25 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  25.57 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3699  cytochrome c1  27.13 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201159  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2758  hypothetical protein  24.75 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1943  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  29.73 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.810872  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  24.05 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  24.8 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  29.29 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2631  hypothetical protein  24.57 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0811  cytochrome c1  26.13 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000393598  hitchhiker  0.0000113285 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1878  cytochrome c1  29.34 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  24.52 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  25.4 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1807  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  28.76 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2696  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  30.59 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3673  cytochrome c1 precursor  30.59 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2872  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.86 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3258  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  30.59 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3648  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  30.59 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3705  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  30.59 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2746  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  30.59 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0416  putative cytochrome C1 transmembrane protein  25.89 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  26.32 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0715  cytochrome c1  24.05 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3541  cytochrome c1  26.06 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2975  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  29.13 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.674351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0791  cytochrome c1  22.61 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0107  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  25 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00110393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>