145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2244 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2244  cytochrome c1  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400916  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  54.09 
 
 		 689 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  50 
 
 		 689 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  52.86 
 
 		 690 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  52.1 
 
 		 687 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  54.83 
 
 		 688 aa  266  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7535  cytochrome c1  52.57 
 
 		 298 aa  263  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834957  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3799  cytochrome c1  52.89 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  51.79 
 
 		 688 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6796  cytochrome c1  50.99 
 
 		 298 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.866248  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0465  cytochrome c1  50 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  45.74 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2164  cytochrome c1  52.05 
 
 		 281 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  49.41 
 
 		 688 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3203  cytochrome c1  49.28 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2767  cytochrome c1  47.31 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2544  cytochrome c1  47.31 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  46.86 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  42.97 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  43.14 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0362  cytochrome c1  46.4 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1539  cytochrome c1  46.29 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00630  electron transporter, transferring electrons within CoQH2-cytochrome c reductase complex, putative  48.12 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0899568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  48.91 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3040  cytochrome c1  49.19 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1541  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1, putative  47.24 
 
 		 295 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2776  cytochrome c1  44.98 
 
 		 294 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0703  cytochrome c1  44.6 
 
 		 284 aa  208  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1490  putative ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  47.24 
 
 		 318 aa  208  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.531378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1625  cytochrome c1  45.52 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  46.18 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0626  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  44.35 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.415478  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28125  predicted protein  49.56 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138363  normal  0.0229296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2472  cytochrome c1  46.27 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.546369  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26515  predicted protein  45.91 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86147  cytochrome c1  44.17 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0277  cytochrome c1  44.44 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2307  cytochrome c1  42.8 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  decreased coverage  0.0079978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1394  cytochrome c1  44.63 
 
 		 280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0676  cytochrome c1  43.65 
 
 		 271 aa  181  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140638  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1394  cytochrome c1 precursor  42.08 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0061  cytochrome c1  42.08 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.197339  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00357  Ubiquinol-cytochrome c reductase (Eurofung)  42.24 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2801  cytochrome c1  37.8 
 
 		 286 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.824407  normal  0.36289 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2812  cytochrome c1  41.7 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0327  cytochrome c1  39.48 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3276  cytochrome c1  38.43 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2946  cytochrome c1  42.29 
 
 		 243 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  32.67 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  27.51 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  28.44 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  28 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  28.12 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  27.68 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  28.12 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  27.68 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  28.12 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  28.12 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  28.12 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  27.68 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  27.68 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  26.2 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  30.95 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  27.68 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  28.19 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  29.33 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  27.62 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  26.3 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  26.55 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1960  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  26.78 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  26.09 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  25.73 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  26.56 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  25.75 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3694  cytochrome c1  24.37 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  25.85 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0754  cytochrome c1  25.73 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0715  cytochrome c1  25.83 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0791  cytochrome c1  25.73 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1422  ubiquinol cytochrome c1 reductase  30.81 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00068249  normal  0.213297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  25.74 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3699  cytochrome c1  26.25 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5501  cytochrome c1  25.27 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  24.9 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  25.42 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2209  cytochrome c1  27.08 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0794  cytochrome c1  28.71 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0108816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  24.08 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1585  cytochrome c1  30.33 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  24.68 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2631  hypothetical protein  24 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00439  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  27.73 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0811  cytochrome c1  27 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000393598  hitchhiker  0.0000113285 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2758  hypothetical protein  24.44 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2927  putative cytochrome C1 precursor transmembrane protein  28.24 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  25 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00885  ubiquinol-cytochrome c reductase  24.91 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4690  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  25.75 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.0239811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4405  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.97 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.97 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>